Validation of plasma miR-371a-3p expression in patients with metastatic and early stage germ cell tumor.
Notice bibliographique
Résumé
526 Background: Identification of relapsing/residual viable germ cell malignancy (GCM) is often challenging in patients with CSI on surveillance or with residual post-chemotherapy disease. The presence of a biomarker for GCM would overcome the uncertainty of the current methods and improve the quality of care of those patients. Methods: A 2-cohorts pilot study involving patients with clearcut evidence of GCM (clinical stage IS, metastatic and GCM prior orchiectomy) for the development cohort and patients with CSI with or without signs of tumor relapse and patients with metastatic GCM post-chemotherapy for the validation cohort. Blood samples collected in Streck tubes were obtained prior to chemotherapy for the development cohort and post-orchiectomy, at the time of suspicious relapse or post-chemotherapy in the validation cohort. Plasma miR-371a-3p (miR371) was analyzed by RT-PCR. Positive predictive value (PPV), sensitivity, specificity, negative predictive values (NPV) and AUC of the ROC for miR371 and standard diagnostic tools (CT scan, AFP, BHCG and LDH) were calculated correlating qualitative miR371 expression to the presence of viable GCM. Results: 132 patients were enrolled into the development (33 pts) and validation (99 pts) cohorts. Within the development cohort 31/33 pts were miR371 positive, 2/33 pts were negative. 31 true positives were found among the 31 miR371 positive patients for a PPV of 100% (31/31). Two true negatives were found among the 2 patients who had no miR371 expression identified (teratoma, lymphoma). The validation cohort was chosen to evaluate the methodology among patients with predicted lower volumes or no clinically apparent disease. 13/99 patients within the validation cohort were miR371 positive and all 13 had subsequent confirmation of viable GCM. For the overall study of 132 pts, PPV was 100% (46/46), NPV 98%, sensitivity 96% and specificity 100%, the AUC of the ROC was 0.96. Conclusions: Detectable circulating miR-371a-3p levels predict viable GCM and may represent a strategy for biological rather than radiographic assessment for surveillance of early stage and for post-treatment patients. Larger studies to validate these and like results have been planned.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».