Tenofovir and Emtricitabine Resistance among Antiretroviral-Naive Patients in the Canadian Observational Cohort Collaboration: Implications for PrEP
Notice bibliographique
Résumé
Background The real-world effectiveness of pre-exposure prophylaxis (PrEP) may be influenced by circulating HIV strains resistant to either tenofovir or emtricitabine. Yet, few studies have examined rates of resistance to these drugs in clinical settings. Methods We conducted a retrospective cohort study of antiretroviral-naive participants in the Canadian Observational Cohort collaboration who initiated antiretroviral therapy between 2006 and 2014. In separate analyses, we determined the prevalence of pretherapy resistance and cumulative incidence of follow-up resistance to tenofovir and emtricitabine. We used multivariable proportional hazards models to examine associations between baseline variables and the development of resistance. Results We studied 6,622 antiretroviral-naive participants initiating therapy, of whom 5,428 (82.0%) had a baseline resistance test. Baseline resistance to tenofovir and emtricitabine was observed in 83 (1.5%) and 21 (0.4%) patients, respectively. Among patients without baseline resistance, the cumulative incidence of resistance to tenofovir and emtricitabine 5 years following treatment initiation was 0.0070 (95% CI 0.0046, 0.0095) and 0.033 (95% CI 0.028, 0.038), respectively. Following multivariable analysis, a baseline viral load ≥100,000 copies/ml was associated with emergence of tenofovir (hazard ratio [HR] 2.88; 95% CI 1.35, 6.15) and emtricitabine (HR 2.27; 95% CI 1.64, 3.15) resistance. Initiating an integrase inhibitor-based regimen and CD4 + T-cell count below 200 cells/mm 3 were also associated with resistance to each drug. Conclusions We observed a low prevalence of baseline resistance and a low incidence of emergence of resistance to tenofovir and emtricitabine among antiretroviral-naive patients in routine clinical care.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,008 | 0,018 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,004 |
| Études des sciences et des technologies | 0,003 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,003 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».