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Enregistrement W2921792886 · doi:10.1016/j.trci.2019.07.001

Forecasting the progression of Alzheimer's disease using neural networks and a novel preprocessing algorithm

2019· preprint· en· W2921792886 sur OpenAlexfundno aff
Jack Albright

Notice bibliographique

RevueAlzheimer s & Dementia Translational Research & Clinical Interventions · 2019
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDementia and Cognitive Impairment Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute on AgingNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringCanadian Institutes of Health ResearchGenentechNational Institutes of HealthH. Lundbeck A/SServierEisaiNorthern California Institute for Research and EducationAlzheimer's AssociationFujirebio USPfizerBiogenBioClinicaF. Hoffmann-La RocheIXICOTakeda Pharmaceutical CompanyAbbVieRocheUniversity of Southern CaliforniaNovartis Pharmaceuticals CorporationU.S. Department of DefenseEli Lilly and CompanyBristol-Myers SquibbAlzheimer's Drug Discovery FoundationMerckFoundation for the National Institutes of HealthGE HealthcareAlzheimer's Disease Neuroimaging InitiativeMeso Scale Diagnostics
Mots-clésNeuroimagingClinical trialDiseaseMachine learningArtificial neural networkCognitive impairmentArtificial intelligenceCognitionComputer scienceAlzheimer's diseaseAlzheimer's Disease Neuroimaging InitiativeMedicinePsychologyInternal medicinePsychiatry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Introduction There is a 99.6% failure rate of clinical trials for drugs to treat Alzheimer's disease, likely because Alzheimer's disease (AD) patients cannot be easily identified at early stages. This study investigated machine learning approaches to use clinical data to predict the progression of AD in future years. Methods Data from 1737 patients were processed using the “All‐Pairs” technique, a novel methodology created for this study involving the comparison of all possible pairs of temporal data points for each patient. Machine learning models were trained on these processed data and evaluated using a separate testing data set (110 patients). Results A neural network model was effective (mAUC = 0.866) at predicting the progression of AD, both in patients who were initially cognitively normal and in patients suffering from mild cognitive impairment. Discussion Such a model could be used to identify patients at early stages of AD and who are therefore good candidates for clinical trials for AD therapeutics.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,021

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,417
Tête enseignante GPT0,535
Écart entre enseignants0,118 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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