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Enregistrement W2921855062 · doi:10.1002/ajb2.1243

Evolution of <i>RADIALIS</i> and <i>DIVARICATA</i> gene lineages in flowering plants with an expanded sampling in non‐core eudicots

2019· article· en· W2921855062 sur OpenAlexfundno aff
Yesenia Madrigal, Juan F. Álzate, Favio González, Natalia Pabón‐Mora

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Botany · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Diversity and Evolution
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Cheng Kung UniversityUniversidad de AntioquiaAcademia SinicaUniversity of AlbertaBiodiversa+
Mots-clésBiologyPerianthEudicotsPetalEvolutionary biologyBotanyLineage (genetic)GeneGeneticsTaxonomy (biology)Stamen

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PREMISE OF THE STUDY: Bilateral symmetry in core eudicot flowers is established by the differential expression of CYCLOIDEA (CYC), DICHOTOMA (DICH), and RADIALIS (RAD), which are restricted to the dorsal portion of the flower, and DIVARICATA (DIV), restricted to the ventral and lateral petals. Little is known regarding the evolution of these gene lineages in non-core eudicots, and there are no reports on gene expression that can be used to assess whether the network predates the diversification of core eudicots. METHODS: Homologs of the RAD and DIV lineages were isolated from available genomes and transcriptomes, including those of three selected non-core eudicot species, the magnoliid Aristolochia fimbriata and the monocots Cattleya trianae and Hypoxis decumbens. Phylogenetic analyses for each gene lineage were performed. RT-PCR was used to evaluate the expression and putative contribution to floral symmetry in dissected floral organs of the selected species. KEY RESULTS: RAD-like genes have undergone at least two duplication events before eudicot diversification, three before monocots and at least four in Orchidaceae. DIV-like genes also duplicated twice before eudicot diversification and underwent independent duplications specific to Orchidaceae. RAD-like and DIV-like genes have differential dorsiventral expression only in C. trianae, which contrasts with the homogeneous expression in the perianth of A. fimbriata. CONCLUSIONS: Our results point to a common genetic regulatory network for floral symmetry in monocots and core eudicots, while alternative genetic mechanisms are likely driving the bilateral perianth symmetry in the early-diverging angiosperm Aristolochia.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,363
Score d'incertitude au seuil0,159

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,208
Écart entre enseignants0,194 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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