MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2921855504 · doi:10.1093/cz/zoz002

Genetic variation and cryptic lineage diversity of the Nigerian red-headed rock agama Agama agama associate with eco-geographic zones

2019· article· en· W2921855504 sur OpenAlexaff
Lotanna M. Nneji, Adeniyi C. Adeola, Yan Fang, Agboola O. Okeyoyin, Ojo C. Oladipo, Yohanna Saidu, Dinatu Samuel, Ifeanyi C. Nneji, Akindele Oluwatosin Adeyi, Abiodun B. Onadeko, Temidayo Ebenezer Olagunju, Olatunde Omotoso, Segun O. Oladipo, Oluyinka A. Iyiola, John Yinamga Usongo, Timothy Auta, Abbas D. Usman, Halima Abdullahi, Odion O. Ikhimiukor, Weiwei Zhou, Jie‐Qiong Jin, Obih Alex Ugwumba, A.A.A. Ugwumba, Min‐Sheng Peng, Robert W. Murphy, Jing Che

Notice bibliographique

RevueCurrent Zoology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensRoyal Ontario Museum
Organismes subventionnairesSino-Africa Joint Research Center, Chinese Academy of SciencesYouth Innovation Promotion Association of the Chinese Academy of SciencesYouth Innovation Promotion AssociationNational Park ServiceChinese Academy of Sciences
Mots-clésLineage (genetic)BiologyEvolutionary biologyDiversity (politics)Genetic diversityZoologyGeographyGeneticsDemographyAnthropologyGeneSociology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Nigeria is an Afrotropical region with considerable ecological heterogeneity and levels of biotic endemism. Among its vertebrate fauna, reptiles have broad distributions, thus, they constitute a compelling system for assessing the impact of ecological variation and geographic isolation on species diversification. The red-headed rock agama, Agama agama, lives in a wide range of habitats and, thus, it may show genetic structuring and diversification. Herein, we tested the hypothesis that ecology affects its genetic structure and population divergence. Bayesian inference phylogenetic analysis of a mitochondrial DNA (mtDNA) gene recovered four well-supported matrilines with strong evidence of genetic structuring consistent with eco-geographic regions. Genetic differences among populations based on the mtDNA also correlated with geographic distance. The ecological niche model for the matrilines had a good fit and robust performance. Population divergence along the environmental axes was associated with climatic conditions, and temperature ranked highest among all environmental variables for forest specialists, while precipitation ranked highest for the forest/derived savanna, and savanna specialists. Our results cannot reject the hypothesis that niche conservatism promotes geographic isolation of the western populations of Nigerian A. agama. Thus, ecological gradients and geographic isolation impact the genetic structure and population divergence of the lizards. This species might be facing threats due to recent habitat fragmentation, especially in western Nigeria. Conservation actions appear necessary.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,017
Score d'incertitude au seuil0,568

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,204
Écart entre enseignants0,196 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCurrent ZoologyMême sujetGenetic diversity and population structureTravaux en français237 207