MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2921898382 · doi:10.1021/acs.est.8b06643

Mechanistic Dichotomy in Bacterial Trichloroethene Dechlorination Revealed by Carbon and Chlorine Isotope Effects

2019· article· en· W2921898382 sur OpenAlexafffund
Christina Lihl, Lisa M. Douglas, Steffi Franke, Alfredo Pérez‐de‐Mora, Armin Meyer, Martina Daubmeier, Elizabeth A. Edwards, Ivonne Nijenhuis, Barbara Sherwood Lollar, Martin Elsner

Notice bibliographique

RevueEnvironmental Science & Technology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMicrobial bioremediation and biosurfactants
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaDeutsche Forschungsgemeinschaft
Mots-clésChlorineEnvironmental chemistryIsotopes of carbonCarbon fibersEnvironmental scienceChemistryReductive dechlorinationBiodegradationTotal organic carbonOrganic chemistryMaterials science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Tetrachloroethene (PCE) and trichloroethene (TCE) are significant groundwater contaminants. Microbial reductive dehalogenation at contaminated sites can produce nontoxic ethene but often stops at toxic cis -1,2-dichloroethene ( cis -DCE) or vinyl chloride (VC). The magnitude of carbon relative to chlorine isotope effects (as expressed by Λ C/Cl, the slope of δ 13 C versus δ 37 Cl regressions) was recently recognized to reveal different reduction mechanisms with vitamin B 12 as a model reactant for reductive dehalogenase activity. Large Λ C/Cl values for cis -DCE reflected cob(I)alamin addition followed by protonation, whereas smaller Λ C/Cl values for PCE evidenced cob(I)alamin addition followed by Cl – elimination. This study addressed dehalogenation in actual microorganisms and observed identical large Λ C/Cl values for cis -DCE (Λ C/Cl = 10.0 to 17.8) that contrasted with identical smaller Λ C/Cl for TCE and PCE (Λ C/Cl = 2.3 to 3.8). For TCE, the trend of small Λ C/Cl could even be reversed when mixed cultures were precultivated on VC or DCEs and subsequently confronted with TCE (Λ C/Cl = 9.0 to 18.2). This observation provides explicit evidence that substrate adaptation must have selected for reductive dehalogenases with different mechanistic motifs. The patterns of Λ C/Cl are consistent with practically all studies published to date, while the difference in reaction mechanisms offers a potential answer to the long-standing question of why bioremediation frequently stalls at cis -DCE.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,002
Tête enseignante GPT0,180
Écart entre enseignants0,178 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations47
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueEnvironmental Science & TechnologyMême sujetMicrobial bioremediation and biosurfactantsTravaux en français237 207