A needle in a haystack: a multigene TaqMan assay for the detection of Asian gypsy moths in bulk pheromone trap samples
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
The Asian gypsy moth (AGM) is considered a very serious invasive threat in North America. For this reason, it is subjected to a bio-surveillance program that includes an extensive network of pheromone traps. For regulatory purposes, the term “AGM” designates a group of Asian Lymantria species and subspecies, comprising two L. dispar subspecies ( L. d. asiatica and L. d. japonica ), and three closely related species ( L. umbrosa, L. albescens and L. postalba ). These moths are attracted to the same pheromone as the European gypsy moth (EGM), L. dispar dispar , which is already established in North America and typically makes up the bulk of moths caught in gypsy moth pheromone traps. These different Lymantria taxa are difficult to distinguish from one another using morphological characters alone. Here, we designed a TaqMan triplex assay capable of detecting AGM in bulk pheromone trap samples. The assay targets SNPs found in three different mitochondrial genes. Using a DNA dilution series, we show that the assay can detect AGM taxa at AGM:EGM dilution ratios ≥ 1:1000. The assay was validated using batch DNA extractions of moth legs tested at a 1:100 AGM:EGM leg ratio, a proportion that is around the operational limit for a single pheromone trap. The assay provided correct identification for all AGM taxa tested. An experiment examining the integrity of DNA extracted from gypsy moths left in pheromone traps under field conditions for up to 4 months indicated that DNA quality remains sufficient, during that period, for the present assay to remain accurate.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle