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Enregistrement W2921958189 · doi:10.1007/s13361-019-02157-y

Optimization of the Data Treatment Steps of a Non-targeted LC-MS-Based Workflow for the Identification of Trace Chemical Residues in Honey

2019· article· en· W2921958189 sur OpenAlexafffund
Annie von Eyken, Stéphane Bayen

Notice bibliographique

RevueJournal of the American Society for Mass Spectrometry · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePesticide Residue Analysis and Safety
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesFonds de recherche du Québec – Nature et technologiesCanada Foundation for Innovation
Mots-clésChemistryWorkflowChromatographyIdentification (biology)ProteomicsTRACE (psycholinguistics)Mass spectrometryComputational biologyDatabaseBiochemistryComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Non-targeted screening (e.g., suspected-target) is emerging as an attractive tool to investigate the occurrence of contaminants in food. The sample preparation and instrument analysis steps are known to influence the identification of analytes with non-targeted workflows, especially for complex matrices. However, for methods based on mass spectrometry, the impact of the post-analysis data treatment (e.g., feature extraction) on the capacity to correctly identify a contaminant at trace level is currently not well understood. The aim of the study was to investigate the influence of seven post-analysis data treatment parameters on the non-targeted identification of trace contaminants in honey using high-performance liquid chromatography coupled to hybrid quadrupole time-of-flight mass spectrometry (HPLC-QTOF-MS). Seven compounds reported as veterinary drugs for honeybees were applied as model compounds. Among the parameters studied, the expansion window for chromatogram extraction and the average scans included in the spectra influenced significantly the identification process results. The optimized data treatment was applied to the non-targeted screening of veterinary drugs, pesticides, and other contaminants in 55 honey samples as a proof of concept. Among the 43 compounds included in a library of honey-related compounds that was used for screening, eight compounds were tentatively identified in at least one honey sample. The tentative identity of two of these compounds (tylosin A and hydroxymethylfurfural) was further confirmed with analytical standards. Graphical Abstract.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,572
Score d'incertitude au seuil0,154

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,264
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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