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Enregistrement W2922037010 · doi:10.1093/jcag/gwz006.139

A140 AN ATYPICAL NON-CELL AUTONOMOUS REGULATION OF GUT HOMEOSTASIS: THE CONTRIBUTION OF ENTEROCYTES-RELATED AUTOPHAGY

2019· article· en· W2922037010 sur OpenAlexaff
Sonya Nassari, Steve Jean

Notice bibliographique

RevueJournal of the Canadian Association of Gastroenterology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineNursing
ThématiqueChild Nutrition and Water Access
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAutophagyBiologyATG16L1Cell biologyHomeostasisProgenitor cellStem cellGeneticsApoptosis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Inflammatory bowel diseases (IBD) are multifactorial diseases associated with environmental and microbial factors as well as with specific genetic variants. Over the past years, GWAS identified various autophagy-related genes (ATG16L1, LRRK2, VAMP3) as susceptibility variants in IBD. Autophagy is an essential process, defined as the degradation and recycling of cytoplasmic components by the lysosomal machinery. Interestingly, defect in the autophagy process have been revealed in patients suffering from IBD. Although the contribution of autophagy to IBD is well established in Paneth cells, it is still unclear how enterocytes-related autophagy participate in such pathologies. Enterocytes (Ec) define the main intestinal cell population in direct contact with the lumen, thus representing an ideal target for IBD treatments. Our goal is to characterize the effect of autophagy inhibition in Ec on gut homeostasis and its contribution in IBD initiation and development. Drosophila is a well characterized organism with powerful genetic tool, representing an excellent model to investigate intestinal biology, as it is highly conserved with humans. Drosophila gut is composed of intestinal stem cells (ISC) that differentiate into progenitor cells that yield differentiated enteroendocrines (Ee) and Ec cells. Taking advantage of the cell specific inducible GAL4/UAS system available in drosophila, we independently depleted in Ec autophagy-related genes. In such context, various aspects of gut homeostasis were analyzed. Intestinal morphology and functional integrity were evaluated using nucleus staining (DAPI) and permeability assay. Additionally, Ec apoptosis and ISC proliferation were monitored. Furthermore, differentiated cell populations were assessed using Prospero (Ee) and Pdm1 (Ec) immunostaining. Finally, assessment of life survival effect was monitored by establishing lifespan curve. Our results show that silencing of the autophagy-related genes ATG16, VAMP3, ATG5, SYX17 and VAMP8 in drosophila Ec affects different facet of the intestinal epithelium, although it does not perturb either intestinal integrity or lifespan. Indeed, autophagy-related genes inhibition lead to an increase in cell density, which correlate with a gain in the rate of proliferative cells. Furthermore, we observe an increase in the rate of Ee. Such results strongly suggest a non-cell autonomous effect of Ec-related autophagy in regulating ISC proliferation and favoring Ee specification and/or differentiation, thus contributing to maintenance of gut homeostasis. Our data indicate that basal autophagy plays an important role in Ec to regulate intestinal homeostasis through regulation of ISC proliferation and Ee fate. Therefore, as Ec represent the major cell type of the gut, upregulating autophagy in such cells could improve IBD treatments. FRQS and CRMUS

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,021

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,214
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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