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Enregistrement W2922063544 · doi:10.1093/jcag/gwz006.166

A167 ANTIMICROBIAL SUSCEPTIBILITY OF HELICOBACTER PYLORI IN THE SASKATOON HEALTH REGION

2019· article· en· W2922063544 sur OpenAlexaffabout
P Kundapur, Nasim Zamir, Lawrence Worobetz

Notice bibliographique

RevueJournal of the Canadian Association of Gastroenterology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueEssential Oils and Antimicrobial Activity
Établissements canadiensRoyal University HospitalUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHelicobacter pyloriMedicineClarithromycinLevofloxacinAmoxicillinMoxifloxacinRifabutinInternal medicineMetronidazoleGastroenterologyAntibiotic resistanceAntibioticsRapid urease testGastritisMicrobiologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Helicobacter pylori infection has been implicated in the development of duodenal or gastric ulcers, early gastric cancer and gastric mucosa-associated lymphoid tissue lymphomas. The increasing prevalence of antibiotic-resistant strains of H pylori have led to reduced success with traditional H pylori treatments; with some studies reporting eradication in less than 50% of cases. There has been no study completed, to this date, which has investigated regional antibiotic resistance patters of H pylori in the Saskatoon Health Region. Primary Outcome: Is to assess the susceptibility of H. pylori strains isolated from gastric biopsies of patients with peptic ulcer disease to Amoxicillin, Metronidazole, Clarithromycin, Tetracycline, Levofloxacin, Moxifloxacin, and Rifabutin. Secondary Outcome: 1) Standardizes the treatment of H pylori in the Saskatoon Health Region 2) Reduction in healthcare costs associated with inappropriate antibiotic prescribing 3) Analyze potential predictors of H pylori resistance 4) Accuracy of CLO test versus histology in the diagnosis of H pylori This is a prospective study patients suspected to have peptic ulcer disease typically undergo an EGD and biopsies are removed to test for H pylori. For our study, additional biopsies will undergo a CLO test. If the CLO test is positive, the biopsy sample will be sent to the clinical microbiologist for culture and susceptibility testing. We will be looking at the susceptibility of the 50 strains of H pylori to 7 antibiotics, which include: Amoxicillin, Metronidazole, Clarithromycin, Tetracycline, Levofloxacin, Moxifloxacin, and Rifabutin. Prior to undergoing an EGD patients will be invited to participate in a survey, which will collect demographic, lifestyle factors, history of H pylori and treatment and EGD diagnosis. Unfortunately, our project was initiated recently and our results are preliminary. To date, 14 patients have been enrolled of which half are male. The mean age of our cohort is 55.3 (13.5) without a significant age discrepancy between sexes. In our enrolled cohort to date, the CLO test has perfect specificity (100%) but lacks sensitivity (50%). The relative risk of patients who identify as “East Asians” or “First Nations” having H pylori was 14. A McNemar’s test with continuity correction determined that both the CLO test and pathology results were statistically comparable to one another (p < 0.001). Antimicrobial susceptibility testing results for specimens were pending at the time of this report submission. For a cohort size of 14 patients, we have demonstrated and validated the reliability and specificity of CLO test in comparison to histology in the diagnosis of H pylori. Our project is promising and we hope to continue recruitment. Most importantly, our project has economical insights, as we continue to analyze results in our growing cohort. None

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,807
Score d'incertitude au seuil0,983

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,205
Écart entre enseignants0,195 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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