MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W2922100235 · doi:10.1200/jco.2019.37.7_suppl.262

Performance of the 17-gene genomic prostate score test in men with prostate cancer (PCa) managed with active surveillance (AS): Results from the Canary Prostate Active Surveillance Study (PASS).

2019· article· en· W2922100235 sur OpenAlexaff
Daniel W. Lin, Yingye Zheng, Jesse K. McKenney, Marshall Brown, Ruixiao Lu, Michael Crager, Hilary Boyer, James D. Brooks, Atreya Dash, Michael D. Fabrizio, Martin Gleave, Michael A. Liss, Todd M. Morgan, Ian M. Thompson, Andrew A. Wagner, Athanasios C. Tsiatis, Andrea Pingatore, H. Jeffrey Lawrence, Peter S. Nelson, Lisa F. Newcomb

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Oncology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueProstate Cancer Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineProstatectomyProstate cancerBiopsyProstateProportional hazards modelProstate-specific antigenUrologyHazard ratioProstate biopsyInternal medicineConfidence intervalGynecologyCancerOncology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

262 Background: The 17-gene Genomic Prostate Score (GPS) test (scale 0-100) predicts adverse surgical pathology (AP) and recurrence in newly diagnosed low- and intermediate-risk PCa. Studies of the predictive value of the GPS test in men initially managed with AS are limited. Methods: Diagnostic biopsy tissue was obtained from 634 men enrolled at 8 sites in PASS. Time to AP (Gleason Grade Group (GG) ≥3, ≥pT3a, or N1) in men who underwent radical prostatectomy (RP) was the primary endpoint. All diagnostic biopsies and RP specimens were centrally reviewed. Multivariate regression models for interval censored data were used to evaluate the association between time to AP and GPS. Inverse probability of censoring weighting was applied to adjust for informative censoring. Association between GPS and time to Gleason score upgrade on surveillance biopsy was also evaluated using a Cox Proportional Hazards model. Results: GPS results were obtained for 432 men (median follow-up 4.6 [IQR: 2.9-6.2] years); 374 and 58 with GG 1 or 2 cancer, respectively; median PSA density (PSAD) was 0.11 [IQR: 0.08-0.15]; 101 men underwent RP with central pathology after a median of 2.1 [IQR: 1.3-4.3] years surveillance, and 52 (52%) men undergoing RP had AP. 167 men upgraded at a subsequent biopsy. No clinico-pathologic covariates were significantly associated with AP other than PSAD. GPS was significantly associated with time to AP (hazards ratio [HR]/20 GPS units: 1.96 [95% CI = 1.17-4.28]; p = 0.030), when adjusted for diagnostic GG, or for dichotomous PSAD ( < vs ≥ 0.15; HR: 1.83, 95% CI = 1.04-3.62; p = 0.046). GPS was not significantly associated with AP (HR: 1.61, 95% CI = 0.87-2.98; p = 0.12) when adjusted for continuous PSAD. No association, either univariable or multivariable, was observed between GPS and subsequent biopsy upgrade. Conclusions: In a cohort of men on AS, GPS was associated with time to AP when adjusted for diagnostic GG or dichotomous PSAD. GPS was not associated with surveillance biopsy GG upgrading or AP at surgery after adjustment for continuous PSAD, although a trend was seen for AP, suggesting an association may be seen in a larger study.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,354
Écart entre enseignants0,316 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Clinical Oncology→Même sujetProstate Cancer Diagnosis and Treatment→Travaux en français237 207→