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Enregistrement W2922256166 · doi:10.1111/dmcn.14180

A novel classification system for research reporting in rare and progressive genetic conditions

2019· article· en· W2922256166 sur OpenAlexafffund
Clara van Karnebeek, Daniël Beumer, Colleen Pawliuk, Helly Goez, Sara Mostafavi, Gail Andrews, Rose Steele, Harold Siden

Notice bibliographique

RevueDevelopmental Medicine & Child Neurology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Rare Diseases
Établissements canadiensStollery Children's HospitalUniversity of AlbertaYork UniversityBC Children's HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésInter-rater reliabilityConfidence intervalDelphi methodKappaDelphiPsychologyMedicineStatisticsComputer scienceMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

AIM: To create a classification system for severe, rare, and progressive genetic conditions for use in research reporting. METHOD: A modified Delphi consensus technique was used to create and reach agreement on a new system of condition categories. Interrater reliability was tested via two rounds of an online survey whereby physicians classified a subset of conditions using our novel system. Overall percentage agreement and agreement above chance were calculated using Fleiss' kappa (κ). RESULTS: Eleven physicians completed the first Delphi, with an overall agreement of 76.4%, the κ value was 0.57 (95% confidence interval 0.51-0.63), indicating moderate agreement (0.41-0.60) above chance. Based on the first survey several categories were described in more detail. The second survey confirmed a classification system with 12 categories, with an overall percentage agreement among the participants of 82.6%. The overall mean κ value was 0.71 (95% confidence interval 0.65-0.77), indicating substantial agreement (0.61-0.80). INTERPRETATION: Our new system was useful in categorizing a broad range of rare childhood diseases and may be applicable to other rare disease studies; further validation in larger cohorts is required. WHAT THIS PAPER ADDS: This novel 12-category classification system can be used in research reporting in rare and progressive genetic conditions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,084
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,134
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Présentation des résultats · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,916
Score d'incertitude au seuil0,442

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0840,134
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0130,005
Études des sciences et des technologies0,0030,003
Communication savante0,0040,007
Science ouverte0,0030,006
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,338
Écart entre enseignants0,291 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
DomainePrésentation des résultats
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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