Pyruvate carboxylase deficiency type A and type C: Characterization of five novel pathogenic variants in<i>PC</i>and analysis of the genotype–phenotype correlation
Notice bibliographique
Résumé
Pyruvate carboxylase deficiency (PCD) is caused by biallelic mutations of the PC gene. The reported clinical spectrum includes a neonatal form with early death (type B), an infantile fatal form (type A), and a late-onset form with isolated mild intellectual delay (type C). Apart from homozygous stop-codon mutations leading to type B PCD, a genotype-phenotype correlation has not otherwise been discernible. Indeed, patients harboring biallelic heterozygous variants leading to PC activity near zero can present either with a fatal infantile type A or with a benign late onset type C form. In this study, we analyzed six novel patients with type A (three) and type C (three) PCD, and compared them with previously reported cases. First, we observed that type C PCD is not associated to homozygous variants in PC. In silico modeling was used to map former and novel variants associated to type A and C PCD, and to predict their potential effects on the enzyme structure and function. We found that variants lead to type A or type C phenotype based on the destabilization between the two major enzyme conformers. In general, our study on novel and previously reported patients improves the overall understanding on type A and C PCD.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».