Abstract 217: Coronary Artery Disease Locus 1p32.2 Harbors a Flow-Sensitive Endothelial Enhancer that Regulates PLPP3
Notice bibliographique
Résumé
Genome-wide association studies (GWAS) have identified chromosome 1p32.2 as one of the loci most strongly associated with coronary artery disease (CAD) susceptibility; however, the causal mechanism related to this CAD locus remains poorly understood. A unique feature of atherosclerotic vascular disease such as CAD is that atherosclerosis develops preferentially at arterial sites of curvature, branching, and bifurcation where endothelial cells are activated by disturbed blood flow. Recent investigations by us and others strongly implicate PhosphoLipid PhosPhatase 3 (PLPP3, also known as PhosPhatidic-Acid-Phosphatase-type-2B/ PPAP2B or Lipid Phosphate Phosphohydrolase/LPP3) as the causal gene at this locus. PLPP3 encodes an enzyme that suppresses endothelial inflammation and promotes monolayer integrity by hydrolyzing the bioactive lipid lysophosphatidic acid (LPA). Our studies demonstrated that PLPP3 is significantly reduced in vascular endothelium exposed to disturbed flow in vitro and in vivo, as the result of increased miR-92a and reduced KLF2, when compared to cells subjected to unidirectional blood flow. In addition, CAD risk allele at rs17114036 located in 1p32.2 locus is associated with reduced PLPP3 expression in an endothelium-specific manner, shown by expression quantitative trait locus (eQTL). Employing Transposase-Accessible Chromatin using Sequencing (ATAC-Seq), ChIP-Seq, CRISPR/Cas9-based genome editing, luciferase reporters, and allelic imbalance assays, we report here that CAD SNP rs17114036 is located in an endothelial enhancer that is dynamically activated by athero-protective unidirectional flow and deletion of this enhancer causatively reduces PLPP3 expression in vascular endothelium. In addition, CAD risk allele at rs17114036 is associated with reduced activity of this enhancer and its response to unidirectional flow. These results described a new molecular mechanism by which human genetic variance and mechano-transduction converge on critical vascular functions related to atherosclerosis. Moreover, we have engineered innovative polymeric nano-carriers that preferentially target inflamed endothelium and deliver therapeutic nucleotides that intervene in miR92a-PLPP3 signaling in animal models of atherosclerosis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,017 | 0,004 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».