MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2922840916

Evaluation of MR Image Normalization Methods for Cerebral Small Vessel Disease

2012· article· en· W2922840916 sur OpenAlexaffvenue
Alexandra Pulwicki

Notice bibliographique

RevueJournal of undergraduate research in Alberta · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMRI in cancer diagnosis
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNormalization (sociology)Fluid-attenuated inversion recoveryArtificial intelligenceSpatial normalizationPattern recognition (psychology)Computer scienceImage resolutionMagnetic resonance imagingRadiologyMedicine
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The quantitative analysis of magnetic resonance (MR) images requires accurate spatial normalization.This technique requires transforming one image so that it has the same shape,size and orientation as a template. Since normalization aims to minimize the signal intensitydifference between two images, areas with diffuse signal abnormalities are often incorrectlytransformed. It is therefore important to determine whether normalization programs that employlarge deformation frameworks are more accurate than those that use small deformationframeworks. This is particularly relevant when looking at images of patients with cerebral smallvessel disease (SVD), which is a group of pathological processes that results in subcortical lesions.A deformation field, defined by the user, was applied to twelve sets of patient scans consistingof T1-weighted, proton density (PD), and Fluid attenuated inversion recovery (FLAIR) images.Three widely used normalization programs that employ small (FNIRT, ANTS) and large (SyN)deformation frameworks were utilized to normalize the warped scans to the original images.Relative percent error was then generated for each sequence by finding the percent differencebetween the normalized and original image. Figure 1 shows the sequence of images producedusing the SyN normalization routine for one slice of a FLAIR image. It was found that every MRsequence normalized using SyN (large deformation framework) had a smaller percent differencethan images normalized using FNIRT or ANTS (small deformation framework). Using SyN, therelative percent errors were: eT1= 8.1%, ePD = 5.8%, eFLAIR = 30.8%. The images normalizedwith FNIRT had relative percent errors of: eT1 = 8.5%, ePD = 56.8%, eFLAIR = 66.6% and usingANTS, the relative percent errors were: eT1= 15.6%, ePD = 10.3%, eFLAIR = 52.3%. It wasconcluded that the large deformation framework was the more robust method of normalizingMR images with SVD.16

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,017
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,051
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,017
Score d'incertitude au seuil0,090

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0170,051
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,222
Tête enseignante GPT0,516
Écart entre enseignants0,294 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of undergraduate research in AlbertaMême sujetMRI in cancer diagnosisTravaux en français237 207