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Enregistrement W2922865222 · doi:10.1164/rccm.201901-0145oc

Correlating Cystic Fibrosis Transmembrane Conductance Regulator Function with Clinical Features to Inform Precision Treatment of Cystic Fibrosis

2019· article· en· W2922865222 sur OpenAlexaff
Allison F. McCague, Karen S. Raraigh, Matthew J. Pellicore, Emily F. Davis-Marcisak, Taylor A. Evans, Sangwoo T. Han, Zhongzhou Lu, Anya T. Joynt, Neeraj Sharma, Carlo Castellani, Joseph M. Collaco, Mary Corey, Michelle Lewis, Chris M. Penland, Johanna M. Rommens, Anne L. Stephenson, Patrick R. Sosnay, Garry R. Cutting

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Respiratory and Critical Care Medicine · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCystic Fibrosis Research Advances
Établissements canadiensCystic Fibrosis CanadaSt. Michael's HospitalHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Heart, Lung, and Blood InstituteNational Institutes of HealthCystic Fibrosis Foundation
Mots-clésCystic fibrosisCystic fibrosis transmembrane conductance regulatorIvacaftorMedicineLung functionPhenotypePulmonary function testingGenotypeClinical trialFunction (biology)Internal medicineEndocrinologyLungBiologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Rationale The advent of precision treatment for cystic fibrosis using small-molecule therapeutics has created a need to estimate potential clinical improvements attributable to increases in cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) function. Objectives To derive CFTR function of a variety of CFTR genotypes and correlate with key clinical features (sweat chloride concentration, pancreatic exocrine status, and lung function) to develop benchmarks for assessing response to CFTR modulators. Methods CFTR function assigned to 226 unique CFTR genotypes was correlated with the clinical data of 54,671 individuals enrolled in the Clinical and Functional Translation of CFTR (CFTR2) project. Cross-sectional FEV1% predicted measurements were plotted by age at which measurement was obtained. Shifts in sweat chloride concentration and lung function reported in CFTR modulator trials were compared with function–phenotype correlations to assess potential efficacy of therapies. Measurements and Main Results CFTR genotype function exhibited a logarithmic relationship with each clinical feature. Modest increases in CFTR function related to differing genotypes were associated with clinically relevant improvements in cross-sectional FEV1% predicted over a range of ages (6–82 yr). Therapeutic responses to modulators corresponded closely to predictions from the CFTR2-derived relationship between CFTR genotype function and phenotype. Conclusions Increasing CFTR function in individuals with severe disease will have a proportionally greater effect on outcomes than similar increases in CFTR function in individuals with mild disease and should reverse a substantial fraction of the disease process. This study provides reference standards for clinical outcomes that may be achieved by increasing CFTR function.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,720
Score d'incertitude au seuil0,718

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,355
Écart entre enseignants0,332 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeAutre devis
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations99
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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