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Enregistrement W2923362859 · doi:10.1038/s41467-019-09086-0

A threonyl-tRNA synthetase-mediated translation initiation machinery

2019· article· en· W2923362859 sur OpenAlexaff
Seung Jae Jeong, Shinhye Park, Loi T. Nguyen, Jungwon Hwang, Eun Young Lee, Hoi-Khoanh Giong, Jeong Soo Lee, Ina Yoon, Ji-Hyun Lee, Jong Hyun Kim, Hoi Kyoung Kim, Doyeun Kim, Won Suk Yang, Seon‐Young Kim, Chan Yong Lee, Kweon Yu, Nahum Sonenberg, Myung Hee Kim, Sung‐Hoon Kim

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA and protein synthesis mechanisms
Établissements canadiensOccupational Cancer Research CentreMcGill University
Organismes subventionnairesMinistry of Science and ICT, South KoreaNational Research Foundation of KoreaKorea Research Institute of Bioscience and BiotechnologyNational Research Foundation
Mots-clésBiologyTranslation (biology)Transfer RNAEukaryotic translationAminoacyl tRNA synthetaseProtein biosynthesisEukaryotic initiation factorCell biologyEIF4ETranslational regulationFunction (biology)Computational biologyRNAGeneticsGeneMessenger RNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A fundamental question in biology is how vertebrates evolved and differ from invertebrates, and little is known about differences in the regulation of translation in the two systems. Herein, we identify a threonyl-tRNA synthetase (TRS)-mediated translation initiation machinery that specifically interacts with eIF4E homologous protein, and forms machinery that is structurally analogous to the eIF4F-mediated translation initiation machinery via the recruitment of other translation initiation components. Biochemical and RNA immunoprecipitation analyses coupled to sequencing suggest that this machinery emerged as a gain-of-function event in the vertebrate lineage, and it positively regulates the translation of mRNAs required for vertebrate development. Collectively, our findings demonstrate that TRS evolved to regulate vertebrate translation initiation via its dual role as a scaffold for the assembly of initiation components and as a selector of target mRNAs. This work highlights the functional significance of aminoacyl-tRNA synthetases in the emergence and control of higher order organisms.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,276
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations67
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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