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Enregistrement W2923466071 · doi:10.1080/2162402x.2019.1581545

WISP1 is associated to advanced disease, EMT and an inflamed tumor microenvironment in multiple solid tumors

2019· article· en· W2923466071 sur OpenAlexafffund
Pierre-Olivier Gaudreau, Sylvie Clairefond, Caleb A. Class, Pierre-Luc Boulay, Pavel Chrobák, Bertrand Allard, Féryel Azzi, Sandra Pommey, Kim‐Anh Do, Fred Saad, Dominique Trudel, Marian F. Young, John Stagg

Notice bibliographique

RevueOncoImmunology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueConnective Tissue Growth Factor Research
Établissements canadiensUniversité de MontréalCentre Hospitalier de l’Université de Montréal
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteFonds de Recherche du Québec - SantéNational Institute of Dental and Craniofacial ResearchCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of Health
Mots-clésCancer researchTumor microenvironmentProstate cancerImmunotherapyMedicineImmune checkpointImmune systemCancerOncologyInternal medicineImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: WNT1-Inducible Signaling Pathway Protein 1 (WISP1) is implicated in prostate cancer growth and metastasis and the regulation of inflammation in diverse benign diseases. The objectives of this study were to assess the prognostic value of WISP1, its association to inflammation and its relevance as a biomarker for immune checkpoint blockade (ICB) response.Methods: Publicly available RNA-seq datasets were used to evaluate the prognostic value of WISP1 gene expression and its association with tumor-infiltrating lymphocytes, inflamed tumor microenvironment, and anti-PD-1 ICB response. A tissue microarray (TMA) including 285 radical prostatectomy specimens was used to confirm these associations in prostate cancer. The effect of recombinant WISP1 (rWISP1) on inflammatory cytokines was assessed in vitro.Results: High levels of WISP1 correlated with BCR-free survival in prostate adenocarcinoma and overall survival in primary melanoma, low-grade glioma, and kidney papillary cell carcinoma. Some effects could be accounted for by higher WISP1 expression in advanced disease. High WISP1 expression in prostate adenocarcinoma was correlated with CD8+ cells density. In vitro, rWISP1 increased inflammatory cytokine production. High WISP1 gene expression in RNA-seq datasets was correlated with gene signatures of multiple immune cell types as well as an inflammatory cytokine, immune checkpoint, and epithelial-mesenchymal transition (EMT) gene expression. WISP1 mRNA expression was associated with primary resistance to ICB in datasets showing EMT.Conclusions: Our results support an association between WISP1 expression and advanced disease, EMT and an inflamed tumor microenvironment in multiple solid tumors. The consequences of WISP1 expression on cancer immunotherapy remains to be addressed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,280
Écart entre enseignants0,271 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations33
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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