Altered Promoter and G-Box Binding Factor for 1-Deoxy-d-Xylulose-5-Phosphate Synthase Gene Grown from Poa pratensis Seeds after Spaceflight
Notice bibliographique
Résumé
In plant cells, the nucleus DNA is considered the primary site of injury by the space environment, which could generate genetic alteration. As the part of genomic mutation, genetic variation in the promoter region could regulate gene expression. In the study, it is observed that there is a deletion in the upstream regulatory region of the 1-deoxy-d-xylulose-5-phosphate synthase 1 gene (PpDXS1) of Poa pratensis dwarf mutant and the PpDXS1 transcript abundance is lower in the dwarf mutant. It is indicated that the deletion in the promoter region between wild type and dwarf mutant could be responsible for the regulation of PpDXS1 gene expression. The PpDXS1 promoter of dwarf mutant shows a lower activity as determined by dual luciferase assay in Poa pratensis protoplast, as well as the GUS activity is lower in transgenic Poa pratensis plant. To further investigate the effect of the deletion in the promoter region on PpDXS1 transcript accumulation, the transient assay and yeast one-hybrid experiment demonstrate that the deletion comprises a motif which is a target of G-box binding factor (GBF1), and the motif correlates with an increase in transactivation by GBF1 protein. Taken together, these results indicate that the deletion in the promoter of PpDXS1 isolated from dwarf mutant is sufficient to account for the decrease in PpDXS1 transcript level and GBF1 can regulate the PpDXS1 gene expression, and subsequently affect accumulation of various isoprenoids throughout the plant.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».