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Enregistrement W2923756509 · doi:10.1101/587212

NOD1 mediates non-canonical inflammasome processing of interleukin-18 in epithelial cells to <i>Helicobacter pylori</i> infection

2019· preprint· en· W2923756509 sur OpenAlexafffund
Le Son Tran, Le Ying, Kimberley D’Costa, Georgie Wray‐McCann, Genevieve Kerr, L. Le, Cody C. Allison, Jonathan Ferrand, Hassan Chaudhry, Jack Emery, Amanda De Paoli, Sarah J. Creed, Maria Kaparakis‐Liaskos, Julia Como, Jennifer K. Dowling, Priscilla Johanesen, Thomas A. Kufer, Jakob Skou Pedersen, Ashley Mansell, Dana J. Philpott, Kirstin Elgass, Helen E. Abud, Ueli Nachbur, Ben A. Croker, Seth L. Masters, Richard L. Ferrero

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2019
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInflammasome and immune disorders
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesMonash Biomedicine Discovery Institute, Monash UniversityNational Health and Medical Research CouncilHudson Institute of Medical ResearchState Government of VictoriaUniversity of MelbourneMonash UniversityMedical Research CouncilPublic Health AgencyPublic Health Agency of CanadaU.S. Department of Defense
Mots-clésInflammasomeNOD1Pyrin domainCell biologyHelicobacter pyloriBiologyRegulatorInterleukinImmunologyMyeloid cellsCaspase 1MyeloidInnate immune systemInflammationCytokineNOD2Immune systemGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The interleukin-1 family members, IL-1β and IL-18, are processed into their biologically active forms by multi-protein complexes, known as inflammasomes. Although the inflammasome pathways that mediate IL-1β processing in myeloid cells have been extensively studied, those involved in IL-18 processing, particularly in non-myeloid cells, are still poorly understood. Here, we have identified the cytosolic sensor NOD1 as a key regulator of IL-18 processing in epithelial cells responding to Helicobacter pylori infection. Importantly, NOD1 processing of IL-18 occurs independently of the canonical inflammasome proteins, NLRP3 and ASC. Instead, NOD1 interacts directly with caspase-1 via homotypic binding of caspase-activation recruitment domains. We show that IL-18 is important in maintaining tissue homeostasis and protecting against pre-neoplastic changes due to gastric H. pylori infection. These findings reveal an unanticipated role for NOD1 in a new type of inflammasome that regulates epithelial cell production of bioactive IL-18 with tissue protective functions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,219
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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