A community analysis approach to parasite transmission in multi-host systems: Assemblages of small mammal prey and Echinococcus multilocularis in an urban area in North America
Notice bibliographique
Résumé
Background Echinococcus multilocularis ( Em ) is a parasite with a complex life cycle whose transmission involves a predator-prey interaction. Accidental ingestion of Em eggs by humans may cause alveolar echinococcosis, a potentially fatal disease. Although previous research suggested that the composition of the assemblage of prey species may play a key role in the transmission, the relation between Em presence and the prey assemblages has never been analyzed. Herein, we propose a community analysis approach, based on assemblage similarity statistics, clustering, non-metric dimensional scaling and GLM modelling to analyze the relationships between small mammal assemblages, environmental variables, and the prevalence of Em in intermediate and definitive hosts in an urban area. Results In our study areas within the City of Calgary, Alberta (Canada), we identified three main small mammal assemblages associated with different prevalence of Em , characterized by a different proportion of species known to be good intermediate hosts for Em . As expected, assemblages with higher proportion of species susceptible to Em were observed with higher prevalence of parasite, whereas the total abundance per se of small mammals was not a predictor of transmission likely due to dilution effect. Furthermore, these assemblages were also predicted by simple environmental proxies such as land cover and terrain. Conclusions Our results indicated that the use of a community analysis approach allows for robust characterization of these complex and multivariate relationships, and may offer a promising tool for further understanding of parasite epidemiology in complex multi-host systems. In addition, this analysis indicates that it is possible to predict potential foci of disease risk within urban areas using environmental data commonly available to city planners and land managers.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,004 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».