External validation and recalibration of the Brock model to predict probability of cancer in pulmonary nodules using NLST data
Notice bibliographique
Résumé
INTRODUCTION: We performed an external validation of the Brock model using the National Lung Screening Trial (NLST) data set, following strict guidelines set forth by the Transparent Reporting of a multivariable prediction model for Individual Prognosis Or Diagnosis statement. We report how external validation results can be interpreted and highlight the role of recalibration and model updating. MATERIALS AND METHODS: , we identified 7879 non-calcified nodules discovered at the baseline low-dose CT screen with 2 years of follow-up. We characterised differences between Pan-Canadian Early Detection of Lung Cancer Study and NLST cohorts. We calculated the slope on the prognostic index and the intercept coefficient by fitting the original Brock model to NLST. We also assessed the impact of model recalibration and the addition of new covariates such as body mass index, smoking status, pack-years and asbestos. RESULTS: While the area under the curve (AUC) of the model was good, 0.905 (95% CI 0.882 to 0.928), a histogram plot showed that the model poorly differentiated between benign and malignant cases. The calibration plot showed that the model overestimated the probability of cancer. In recalibrating the model, the coefficients for emphysema, spiculation and nodule count were updated. The updated model had an improved calibration and achieved an optimism-corrected AUC of 0.912 (95% CI 0.891 to 0.932). Only pack-year history was found to be significant (p<0.01) among the new covariates evaluated. CONCLUSION: While the Brock model achieved a high AUC when validated on the NLST data set, the model benefited from updating and recalibration. Nevertheless, covariates used in the model appear to be insufficient to adequately discriminate malignant cases.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».