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Enregistrement W2924805899

Disentangling the genetics of lean mass

2019· article· en· W2924805899 sur OpenAlexaff
David Karasik, M. Carola Zillikens, Yi‐Hsiang Hsu, Ali A. Aghdassi, Kristina Åkesson, Najaf Amin, Inês Barroso, David A. Bennett, Lars Bertram, Murielle Bochud, Ingrid B. Borecki, Linda Broer, Aron S. Buchman, Liisa Byberg, Harry Campbell, Natalia Campos‐Obando, Jane A. Cauley, Peggy M. Cawthon, John C. Chambers, Zhao Chen, Nam H. Cho, Hyung Jin Choi, Wen‐Chi Chou, Steven R. Cummings, Lisette C. P. G. M. de Groot, Phillip L. De Jager, Ilja Demuth, Luda Diatchenko, Michael J. Econs, Guðný Eiríksdóttir, Anke W. Enneman, Joel Eriksson, Johan G. Eriksson, Karol Estrada, Daniel S. Evans, Mary F. Feitosa, Mao Fu, Christian Gieger, Harald Grallert, Vilmundur Guðnason, Launer J. Lenore, Caroline Hayward, Albert Hofman, Georg Homuth, Kim M. Huffman, Lise B. Husted, Thomas Illig, Erik Ingelsson, Till Ittermann, John‐Olov Jansson, Toby Johnson, Reiner Biffar, Joanne M. Jordan, Antti Jula, Magnus K. Karlsson, Kay‐Tee Khaw, Tuomas O. Kilpeläinen, Norman Klopp, Jacqueline S. L. Kloth, Daniel L. Koller, Jaspal S. Kooner, William E. Kraus, Stephen B. Kritchevsky, Zoltán Kutalik, Teemu Kuulasmaa, Johanna Kuusisto, Markku Laakso, Jari Lahti, Thomas Lang, Bente Langdahl, Markus M. Lerch, Joshua R. Lewis, Christina M. Lill, Lars Lind, Cecilia M. Lindgren, Ching‐Ti Liu, Gregory Livshits, Östen Ljunggren, Ruth J. F. Loos, Mattias Lorentzon, Jian’an Luan, Robert Luben, Ida Malkin, Fiona E. McGuigan, Carolina Medina‐Gómez, Thomas Meitinger, Håkan Melhus, Dan Mellström, Karl Michaëlsson, Braxton D. Mitchell, Andrew P. Morris, Leif Mosekilde, Maria Nethander, Anne B. Newman, Jeffery R. O’Connell, Ben A. Oostra, Eric Orwoll, Aarno Palotie, Munro Peacock, Markus Perola, Annette Peters, Richard L. Prince, Bruce M. Psaty, Katri Räikkönen, Stuart H. Ralston, Samuli Ripatti, Fernando Rivadeneira, John A. Robbins, Jerome I. Rotter, Igor Rudan, Veikko Salomaa, Suzanne Satterfield, Sabine Schipf, Chan Soo Shin, Albert V. Smith, Shad B. Smith, Nicole Soranzo, Timothy D. Spector, Alena Stančáková, Kāri Stefánsson, Elisabeth Steinhagen–Thiessen, Lisette Stolk, Elizabeth A. Streeten, Unnur Styrkársdóttir, Karin M. A. Swart, Paul M. Thompson, Cynthia A. Thomson, Guðmar Þorleifsson, Unnur Þorsteinsdóttir, Emmi Tikkanen, Gregory J. Tranah, André G. Uitterlinden, Cornelia M. van Duijn, Natasja M. van Schoor, Liesbeth Vandenput, Péter Vollenweider, Henry Völzke, Jean Wactawski‐Wende, Mark S. Walker, Nicholas J. Wareham, Dawn Waterworth, Michael N. Weedon, H‐Erich Wichmann, Elisabeth Widén, Frances M. K. Williams, James F. Wilson, Nicole C. Wright, Laura M. Yerges‐Armstrong, Lei Yu, Weihua Zhang, Jing Hua Zhao, Yanhua Zhou, Carrie M. Nielson, Tamara B. Harris, Serkalem Demissie, Douglas P. Kiel, Claes Ohlsson

Notice bibliographique

RevuePure Amsterdam UMC · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueNutrition, Genetics, and Disease
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLean body massSingle-nucleotide polymorphismBioelectrical impedance analysisGenome-wide association studyLocus (genetics)BiologyAlleleGeneticsGenetic associationGenetic architectureQuantitative trait locusBody mass indexGenotypeBody weightEndocrinologyGene
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Lean body mass (LM) plays an important role in mobility and metabolic function. We previously identified five loci associated with LM adjusted for fat mass in kilograms. Such an adjustment may reduce the power to identify genetic signals having an association with both lean mass and fat mass. OBJECTIVES: To determine the impact of different fat mass adjustments on genetic architecture of LM and identify additional LM loci. METHODS: We performed genome-wide association analyses for whole-body LM (20 cohorts of European ancestry with n = 38,292) measured using dual-energy X-ray absorptiometry) or bioelectrical impedance analysis, adjusted for sex, age, age2, and height with or without fat mass adjustments (Model 1 no fat adjustment; Model 2 adjustment for fat mass as a percentage of body mass; Model 3 adjustment for fat mass in kilograms). RESULTS: Seven single-nucleotide polymorphisms (SNPs) in separate loci, including one novel LM locus (TNRC6B), were successfully replicated in an additional 47,227 individuals from 29 cohorts. Based on the strengths of the associations in Model 1 vs Model 3, we divided the LM loci into those with an effect on both lean mass and fat mass in the same direction and refer to those as sumo wrestler loci (FTO and MC4R). In contrast, loci with an impact specifically on LM were termed body builder loci (VCAN and ADAMTSL3). Using existing available genome-wide association study databases, LM increasing alleles of SNPs in sumo wrestler loci were associated with an adverse metabolic profile, whereas LM increasing alleles of SNPs in body builder loci were associated with metabolic protection. CONCLUSIONS: In conclusion, we identified one novel LM locus (TNRC6B). Our results suggest that a genetically determined increase in lean mass might exert either harmful or protective effects on metabolic traits, depending on its relation to fat mass.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,400
Score d'incertitude au seuil0,385

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,229
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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