Structural comparison of the vacuolar and Golgi V-ATPases from <i>Saccharomyces cerevisiae</i>
Notice bibliographique
Résumé
Proton-translocating vacuolar-type ATPases (V-ATPases) are necessary for numerous processes in eukaryotic cells, including receptor-mediated endocytosis, protein maturation, and lysosomal acidification. In mammals, V-ATPase subunit isoforms are differentially targeted to various intracellular compartments or tissues, but how these subunit isoforms influence enzyme activity is not clear. In the yeast Saccharomyces cerevisiae , isoform diversity is limited to two different versions of the proton-translocating subunit a: Vph1p, which is targeted to the vacuole, and Stv1p, which is targeted to the Golgi apparatus and endosomes. We show that purified V-ATPase complexes containing Vph1p have higher ATPase activity than complexes containing Stv1p and that the relative difference in activity depends on the presence of lipids. We also show that V O complexes containing Stv1p could be readily purified without attached V 1 regions. We used this effect to determine structures of the membrane-embedded V O region with Stv1p at 3.1-Å resolution, which we compare with a structure of the V O region with Vph1p that we determine to 3.2-Å resolution. These maps reveal differences in the surface charge near the cytoplasmic proton half-channel. Both maps also show the presence of bound lipids, as well as regularly spaced densities that may correspond to ergosterol or bound detergent, around the c-ring.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».