Copy Number Variants in miR-138 as a Potential Risk Factor for Early-Onset Alzheimer’s Disease
Pourquoi ce travail est dans la base
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Notice bibliographique
Résumé
Early-onset Alzheimer's disease (EOAD) accounts for 5-10% of all AD cases, with a heritability ranging between 92% to 100%. With the exception of rare mutations in APP, PSEN1, and PSEN2 genes causing autosomal dominant EOAD, little is known about the genetic factors underlying most of the EOAD cases. In this study, we hypothesized that copy number variations (CNVs) in microRNA (miR) genes could contribute to risk for EOAD. miRs are short non-coding RNAs previously implicated in the regulation of AD-related genes and phenotypes. Using whole exome sequencing, we screened a series of 546 EOAD patients negative for autosomal dominant EOAD mutations and 597 controls. We identified 86 CNVs in miR genes of which 31 were exclusive to EOAD cases, including a duplication of the MIR138-2 locus. In functional studies in human cultured cells, we could demonstrate that miR-138 overexpression leads to higher Aβ production as well as tau phosphorylation, both implicated in AD pathophysiology. These changes were mediated in part by GSK-3β and FERMT2, a potential risk factor for AD. Additional disease-related genes were also prone to miR-138 regulation including APP and BACE1. This study suggests that increased gene dosage of MIR138-2 could contribute to risk for EOAD by regulating different biological pathways implicated in amyloid and tau metabolism. Additional studies are now required to better understand the role of miR-CNVs in EOAD.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle