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Enregistrement W2925292132 · doi:10.1111/his.13865

Low‐grade oncocytic tumour of kidney (CD117‐negative, cytokeratin 7‐positive): a distinct entity?

2019· article· en· W2925292132 sur OpenAlexafffund
Kiril Trpkov, Sean R. Williamson, Yuan Gao, Petr Martínek, Ankur R. Sangoi, Aslı Yilmaz, Cheng Wang, Pilar Fraile Gómez, Delia Pérez‐Montiel, Stela Bulimbašić, Joanna Rogala, Ondřej Hes

Notice bibliographique

RevueHistopathology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRenal and related cancers
Établissements canadiensDalhousie UniversityQueen Elizabeth II Health Sciences CentreCalgary Laboratory ServicesUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesCalgary Laboratory ServicesUniverzita Karlova v Praze
Mots-clésCD117CytokeratinPathologyCD15VimentinImmunohistochemistryBiologyImmunophenotypingCD34MedicineMolecular biologyStem cellFlow cytometry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

AIM: To describe a group of distinct low-grade oncocytic renal tumours that demonstrate CD117 negative/cytokeratin (CK) 7-positive immunoprofile. METHODS AND RESULTS: We identified 28 such tumours from four large renal tumour archives. We performed immunohistochemistry for: CK7, CD117, PAX8, CD10, AMACR, e-cadherin, CK20, CA9, AE1/AE3, vimentin, BerEP4, MOC31, CK5/6, p63, HMB45, melan A, CD15 and FH. In 14 cases we performed array CGH, with a successful result in nine cases. Median patient age was 66 years (range 49-78 years) with a male-to-female ratio of 1:1.8. Median tumour size was 3 cm (range 1.1-13.5 cm). All were single tumours, solid and tan-brown, without a syndromic association. On microscopy, all cases showed solid and compact nested growth. There were frequent areas of oedematous stroma with loosely arranged cells. The tumour cells had oncocytic cytoplasm with uniformly round to oval nuclei, but without significant irregularities, and showed only focal perinuclear halos. Negative CD117 and positive CK7 reactivity were present in all cases (in two cases there was focal and very weak CD117 reactivity). Uniform reactivity was found for PAX8, AE1/AE3, e-cadherin, BerEP4 and MOC31. Negative stains included CA9, CK20, vimentin, CK5/6, p63, HMB45, Melan A and CD15. CD10 and AMACR were either negative or focally positive; FH was retained. On array CGH, there were frequent deletions at 19p13.3 (seven of nine), 1p36.33 (five of nine) and 19q13.11 (four of nine); disomic status was found in two of nine cases. On follow-up (mean 31.8 months, range 1-118), all patients were alive with no disease progression. CONCLUSION: Low-grade oncocytic tumours that are CD117-negative/CK7-positive demonstrate consistent and readily recognisable morphology, immunoprofile and indolent behaviour.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,215
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations145
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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