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Enregistrement W2926277490 · doi:10.1038/s41467-019-09309-4

Targeting bivalency de-represses Indian Hedgehog and inhibits self-renewal of colorectal cancer-initiating cells

2019· article· en· W2926277490 sur OpenAlexafffund
Evelyne Lima‐Fernandes, Alex Murison, Tiago da Silva Medina, Yadong Wang, Anqi Ma, Cherry Leung, Genna M. Luciani, Jennifer Haynes, Aaron Pollett, Constanze Zeller, Shili Duan, Antonija Kreso, Dalia Baršytė-Lovejoy, Bradly G. Wouters, Jian Jin, Daniel D. De Carvalho, Mathieu Lupien, C.H. Arrowsmith, Catherine O′Brien

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHedgehog Signaling Pathway Studies
Établissements canadiensOntario Institute for Cancer ResearchLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteStructural Genomics ConsortiumPrincess Margaret Cancer CentreToronto General HospitalUniversity of TorontoUniversity Health Network
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthOntario GenomicsOntario Ministry of Research, Innovation and ScienceFonds National de la Recherche LuxembourgGenome CanadaFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São PauloWellcome TrustNovartis PharmaOntario Genomics InstituteNational Cancer InstituteEuropean Federation of Pharmaceutical Industries and AssociationsMerck KGaAEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentEuropean CommissionPfizer
Mots-clésBivalent chromatinH3K4me3EpigeneticsEZH2BiologyChromatinBivalent (engine)Cancer researchHistoneHedgehogStem cellEpigenomicsCell biologyGeneticsDNA methylationPromoterChromatin remodelingChemistryGeneGene expressionSignal transduction

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In embryonic stem cells, promoters of key lineage-specific differentiation genes are found in a bivalent state, having both activating H3K4me3 and repressive H3K27me3 histone marks, making them poised for transcription upon loss of H3K27me3. Whether cancer-initiating cells (C-ICs) have similar epigenetic mechanisms that prevent lineage commitment is unknown. Here we show that colorectal C-ICs (CC-ICs) are maintained in a stem-like state through a bivalent epigenetic mechanism. Disruption of the bivalent state through inhibition of the H3K27 methyltransferase EZH2, resulted in decreased self-renewal of patient-derived C-ICs. Epigenomic analyses revealed that the promoter of Indian Hedgehog (IHH), a canonical driver of normal colonocyte differentiation, exists in a bivalent chromatin state. Inhibition of EZH2 resulted in de-repression of IHH, decreased self-renewal, and increased sensitivity to chemotherapy in vivo. Our results reveal an epigenetic block to differentiation in CC-ICs and demonstrate the potential for epigenetic differentiation therapy of a solid tumour through EZH2 inhibition.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,278
Écart entre enseignants0,268 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations50
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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