Clinical Correlates of Human Immunodeficiency Virus–1 (HIV-1) DNA and Inducible HIV-1 RNA Reservoirs in Peripheral Blood in Children With Perinatally Acquired HIV-1 Infection With Sustained Virologic Suppression for at Least 5 Years
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: The Early Pediatric Initiation Canada Child Cure Cohort (EPIC4) study is a prospective, multicenter, Canadian cohort study investigating human immunodeficiency virus-1 (HIV-1) reservoirs, chronic inflammation, and immune responses in children with perinatally acquired HIV-1 infection. The focus of this report is HIV-1 reservoirs and correlates in the peripheral blood of children who achieved sustained virologic suppression (SVS) for ≥5 years. METHODS: HIV-1 reservoirs were determined by measuring HIV-1 DNA in peripheral blood mononuclear cells and inducible cell-free HIV-1 RNA in CD4+ T-cells by a prostratin analogue stimulation assay. HIV serology was quantified by signal-to-cutoff ratio (S/CO). RESULTS: Of 228 enrolled participants, 69 achieved SVS for ≥5 years. HIV-1 DNA, inducible cell-free HIV-1 RNA, and S/COs correlated directly with the age of effective combination antiretroviral therapy (cART) initiation (P < .001, P = .036, and P < .001, respectively) and age when SVS was achieved (P = .002, P = .038, and P < .001, respectively) and inversely with the proportion of life spent on effective cART (P < .001, P = .01, and P < .001, respectively) and proportion of life spent with SVS (P < .001, P = .079, and P < .001, respectively). Inducible cell-free HIV-1 RNA correlated with HIV-1 DNA, most particularly in children with SVS, without virologic blips, that was achieved with the first cART regimen initiated prior to 6 months of age (rho = 0.74; P = .037) or later (rho = 0.87; P < .001). S/COs correlated with HIV-1 DNA (P = .003), but less so with inducible cell-free HIV-1 RNA (P = .09). CONCLUSIONS: The prostratin analogue stimulation assay, with its lower blood volume requirement, could be a valuable method for evaluating inducible HIV-1 reservoirs in children. Standard commercial HIV serology may be a practical initial indirect measure of reservoir size in the peripheral blood of children with perinatally acquired HIV-1 infection.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».