Genetic and Molecular Analysis of Essential Genes in Centromeric Heterochromatin of the Left Arm of Chromosome 3 in<i>Drosophila melanogaster</i>
Notice bibliographique
Résumé
Abstract A large portion of the Drosophila melanogaster genome is contained within heterochromatic regions of chromosomes, predominantly at centromeres and telomeres. The remaining euchromatic portions of the genome have been extensively characterized with respect to gene organization, function and regulation. However, it has been difficult to derive similar data for sequences within centromeric (centric) heterochromatin because these regions have not been as amenable to analysis by standard genetic and molecular tools. Here we present an updated genetic and molecular analysis of chromosome 3L centric heterochromatin (3L Het). We have generated and characterized a number of new, overlapping deficiencies (Dfs) which remove regions of 3L Het. These Dfs were critically important reagents in our subsequent genetic analysis for the isolation and characterization of lethal point mutations in the region. The assignment of these mutations to genetically-defined essential loci was followed by matching them to gene models derived from genome sequence data: this was done by using molecular mapping plus sequence analysis of mutant alleles, thereby aligning genetic and physical maps of the region. We also identified putative essential gene sequences in 3L Het by using RNA interference to target candidate gene sequences. We report that at least 25, or just under 2/3 of loci in 3L Het, are essential for viability and/or fertility. This work contributes to the functional annotation of centric heterochromatin in Drosophila, and the genetic and molecular tools generated should help to provide important insights into the organization and functions of gene sequences in 3L Het.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».