Physical organization of repetitive sequences and chromosome diversity of barley revealed by fluorescence in situ hybridization (FISH)
Notice bibliographique
Résumé
Fluorescence in situ hybridization (FISH) using oligonucleotides is a simple and convenient method for chromosome research. In this study, 34 of 46 previously developed oligonucleotides produced signals in barley. Together with two plasmid clones and one PCR-amplified cereal centromere repeat (CCS1) probe, 37 repetitive sequences were chromosomally located produced three types of signals covering different positions on the chromosomes. The centromeric and pericentric regions had a more complex genomic organization and sequence composition probably indicative of higher contents of heterochromatin. An efficient multi-plex probe containing eight oligonucleotides and a plasmid clone of 45S rDNA was developed. Thirty-three barley karyotypes were developed and compared. Among them, 11 irradiation-induced mutants of cultivar 08-49 showed no chromosomal variation, whereas 22 cultivar and landrace accessions contained 28 chromosomal polymorphisms. Chromosome 4H was the most variable and 6H was the least variable based on chromosome polymorphic information content (CPIC). Five polymorphic chromosomes (1H-2, 2H-1, 3H-3, 5H-2, and 6H-2) were dominant types, each occurring in more than 50% of accessions. The multi-plex probe should facilitate identification of further chromosomal polymorphisms in barley.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».