Remarkable Structural Diversity of <i>N</i>-Glycan Sulfation on Influenza Vaccines
Notice bibliographique
Résumé
Sulfated N-glycans are biologically important structures derived from enzymatically post-glycosylational modifications of glycoproteins in many therapeutic biologics. The high-throughput analysis of sulfated N-glycomes remains a daunting technical challenge, because of negatively charged heterogeneous composition, large molecular structures, lability of sulfate attachments, and a lack of highly selective enrichment methods. Using liquid chromatography-mass spectrometry, we have analyzed the N-glycans of influenza viral hemagglutinin and neuraminidase from several subtypes of influenza vaccines, and utilized the existing resource to establish an N-glycan library consisting of 927 N-glycan structures and 387 sulfated N-glycan compositions. With the aid of database for data mining, 1380 unique N-glycopeptides were identified and manually validated by de novo glycopeptide sequencing, of which 514 were sulfated at the site-specific locations. We report here a mass spectrometric method that is able to identify and distinguish the isobaric structures of complex and hybrid N-glycans flanked by a terminal sulfation sequon on Gal-GlcNAc and GalNAc-GlcNAc of sulfated-3-Gal, sulfated-6-GlcNAc, and sulfated-4-GalNAc. The database-aided glycoproteomic analyses enable rapid determination of new sulfated-N-glycan structures in large sets of influenza vaccines, including those highly branched nonsialyl sulfo-N-glycans bearing lactosaminic extensions in both complex and hybrid N-glycans that especially interact with sulfotransferases. The novel findings highlight the tremendous structural diversity of sulfated N-glycans and strongly suggest potential functional importance of N-glycan sulfation of influenza glycoproteins.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».