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Enregistrement W2933869706 · doi:10.1093/hmg/ddz071

Robinow syndrome skeletal phenotypes caused by the WNT5AC83S variant are due to dominant interference with chondrogenesis

2019· article· en· W2933869706 sur OpenAlexafffund
Sarah J. Gignac, Sara Hosseini-Farahabadi, Takashi Akazawa, Nathan Schuck, Katherine Fu, Joy M. Richman

Notice bibliographique

RevueHuman Molecular Genetics · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueWnt/β-catenin signaling in development and cancer
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of British Columbia
Mots-clésBiologyPhenotypeChondrogenesisGeneticsCell biologyGeneCell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Heterozygous missense mutations in several genes in the WNT5A signaling pathway cause autosomal dominant Robinow syndrome 1 (DRS1). Our objective was to clarify the functional impact of a missense mutation in WNT5A on the skeleton, one of the main affected tissues in RS. We delivered avian replication competent retroviruses (RCAS) containing human wild-type WNT5A (wtWNT5A), WNT5AC83S variant or GFP/AlkPO4 control genes to the chicken embryo limb. Strikingly, WNT5AC83S consistently caused a delay in ossification and bones were more than 50% shorter and 200% wider than controls. In contrast, bone dimensions in wtWNT5A limbs were slightly affected (20% shorter, 25% wider) but ossification occurred on schedule. The dysmorphology of bones was established during cartilage differentiation. Instead of stereotypical stacking of chondrocytes, the WNT5AC83S-infected cartilage was composed of randomly oriented chondrocytes and that had diffuse, rather than concentrated Prickle staining, both signs of disrupted planar cell polarity (PCP) mechanisms. Biochemical assays revealed that C83S variant was able to activate the Jun N-terminal kinase-PCP pathway similar to wtWNT5A; however, the activity of the variant ligand was influenced by receptor availability. Unexpectedly, the C83S change caused a reduction in the amount of protein being synthesized and secreted, compared to wtWNT5A. Thus, in the chicken and human, RS phenotypes are produced from the C83S mutation, even though the variant protein is less abundant than wtWNT5A. We conclude the variant protein has dominant-negative effects on chondrogenesis leading to limb abnormalities.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,215
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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