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Enregistrement W2934275972 · doi:10.1101/594978

<i>Leptin</i> deficient rats develop nonalcoholic steatohepatitis with unique disease progression

2019· preprint· en· W2934275972 sur OpenAlexaff
Ping Lü, Guang Yang, Wen He, Wanwan Wu, Lingbin Qi, Shijun Shen, Junhua Rao, Guoping Fan, Zhigang Xue, Peng Zhang, Cizhong Jiang, Xianmin Zhu

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2019
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLiver Disease Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensInstitute of Aging
Organismes subventionnairesNational Key Research and Development Program of ChinaNational Natural Science Foundation of ChinaDrexel University
Mots-clésSteatosisNonalcoholic fatty liver diseaseSteatohepatitisTranscriptomeEndocrinologyChemokineBiologyInternal medicineCD68InflammationFatty liverGene expressionMedicineGeneDiseaseImmunohistochemistryBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Nonalcoholic steatohepatitis (NASH) is an aggressive liver disease threatening public health, however its natural history is poorly understood. Unlike ob/ob mice, Lep ∆I14/∆I14 rats develop unique NASH phenotype with steatosis, lymphocyte infiltration and ballooning after postnatal week 16. Using Lep ∆I14/∆I14 rats as NASH model, we studied the natural history of NASH progression by performing an integrated analysis of hepatic transcriptome from postnatal week 4 to 48. Leptin deficiency results in a robust increase in expression of genes encoding 9 rate-limiting enzymes in lipid metabolism such as ACC and FASN. However, genes in positive regulation of inflammatory response are highly expressed at week 16 and then remain the steady elevated expression till week 48. The high expression of cytokines and chemokines including CCL2, TNFα, IL6 and IL1β is correlated with the phosphorylation of several key molecules in pathways such as JNK and NF-κB. Meanwhile, we observed cell infiltration of MPO + neutrophils, CD8 + T cells, CD68 + hepatic macrophages and CCR2 + inflammatory monocyte-derived macrophages, together with macrophage polarization from M2 to M1. Importantly, Lep ∆I14/∆I14 rats share more homologous genes with NASH patients than previously established mouse models and crab eating monkeys with spontaneous hepatic steatosis. Transcriptomic analysis showed that many drug targets in clinical trials can be evaluated in Lep ∆I14/∆I14 rats. Conclusion We characterize Lep ∆I14/∆I14 rats as a unique NASH model by performing a long-term (i.e., 4 to 48 postnatal weeks) integrated transcriptomic analysis. This work reveal the temporal dynamics of hepatic gene expression in lipid metabolism and inflammation, and shed light on understanding the natural history of NASH in human beings.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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