Prevalence of plasmid-mediated AmpC in Enterobacteriaceae isolated from humans and from retail meat in Zagazig, Egypt
Notice bibliographique
Résumé
Background: The objective of this study was to determine the prevalence of plasmid-mediated AmpC (pAmpC) among Enterobacteriaceae isolated from humans and from retail meat in Egypt. Methods: Enterobacteriaceae were isolated from patients with suspected bloodstream infection, human fecal samples, retail chicken meat samples and retail sheep meat samples. All group I Enterobacteriaceae were analyzed for presence of pAmpC genes by PCR. Antibiotic susceptibility testing was performed in all pAmpC positive isolates, followed by phenotypic and genotypic ESBL and carbapenemase testing on indication. Results: The prevalence of pAmpC among group I Enterobacteriaceae isolated from 225 patients with bloodstream infection was 5.6% [95%CI 2.2-13.4]. Among 100 patients with community-onset gastroenteritis the prevalence in fecal samples was 4.8% [95%CI 2.1-10.7]. The prevalence among 112 chicken carcasses and 100 sheep meat samples was 2.4% [95%CI 0.7-8.4] and 1.1% [95%CI 0.2-5.7], respectively. In half of the AmpC positive isolates we detected an ESBL gene and 2 isolates harbored a carbapenemase gene. In five isolates there was resistance to at least three important alternative antibiotic drugs. Conclusions: We consider the prevalence of pAmpC in Egypt, as found in our study, moderately low. To follow future trends in prevalence of pAmpC worldwide, a standardized screening algorithm for the detection of pAmpC is needed.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».