An ATF3-CreERT2 Knock-In Mouse for Axotomy-Induced Genetic Editing: Proof of Principle
Notice bibliographique
Résumé
Genome editing techniques have facilitated significant advances in our understanding of fundamental biological processes, and the Cre-Lox system has been instrumental in these achievements. Driving Cre expression specifically in injured neurons has not been previously possible: we sought to address this limitation in mice using a Cre-ERT2 construct driven by a reliable indicator of axotomy, activating transcription factor 3 (ATF3). When crossed with reporter mice, a significant amount of recombination was achieved (without tamoxifen treatment) in peripherally-projecting sensory, sympathetic, and motoneurons after peripheral nerve crush in hemizygotes (65-80% by 16 d) and was absent in uninjured neurons. Importantly, injury-induced recombination did not occur in Schwann cells distal to the injury, and with a knock-out-validated antibody we verified an absence of ATF3 expression. Functional recovery following sciatic nerve crush in ATF3-deficient mice (both hemizygotes and homozygotes) was delayed, indicating previously unreported haploinsufficiency. In a proof-of-principle experiment, we crossed the ATF3-CreERT2 line with a floxed phosphatase and tensin homolog (PTEN) line and show significantly improved axonal regeneration, as well as more complete recovery of neuromuscular function. We also demonstrate the utility of the ATF3-CreERT2 hemizygous line by characterizing recombination after lateral spinal hemisection (C8/T1), which identified specific populations of ascending spinal cord neurons (including putative spinothalamic and spinocerebellar) and descending supraspinal neurons (rubrospinal, vestibulospinal, reticulospinal and hypothalamic). We anticipate these mice will be valuable in distinguishing axotomized from uninjured neurons of several different classes (e.g., via reporter expression), and in probing the function of any number of genes as they relate to neuronal injury and regeneration.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,007 | 0,003 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».