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Enregistrement W2935540419 · doi:10.1371/journal.ppat.1007656

Supramolecular arrangement of the full-length Zika virus NS5

2019· article· en· W2935540419 sur OpenAlexafffund
Diego S. Ferrero, Victor M. Ruiz-Arroyo, Nicolas Soler, Isabel Usón, Alba Guarné, Núria Verdaguer

Notice bibliographique

RevuePLoS Pathogens · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMosquito-borne diseases and control
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesCentro Nacional de BiotecnologíaNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchMinisterio de Economía y CompetitividadMinisterio de Asuntos Económicos y Transformación Digital, Gobierno de EspañaEuropean Synchrotron Radiation Facility
Mots-clésZika virusFlavivirusDimerBiologyChemistryVirologyVirus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Zika virus (ZIKV), a member of the Flaviviridae family, has emerged as a major public health threat, since ZIKV infection has been connected to microcephaly and other neurological disorders.Flavivirus genome replication is driven by NS5, an RNA-dependent RNA polymerase (RdRP) that also contains a N-terminal methyltransferase domain essential for viral mRNA capping.Given its crucial roles, ZIKV NS5 has become an attractive antiviral target.Here, we have used integrated structural biology approaches to characterize the supramolecular arrangement of the full-length ZIKV NS5, highlighting the assembly and interfaces between NS5 monomers within a dimeric structure, as well as the dimer-dimer interactions to form higher order fibril-like structures.The relative orientation of each monomer within the dimer provides a model to explain the coordination between MTase and RdRP domains across neighboring NS5 molecules and mutational studies underscore the crucial role of the MTase residues Y25, K28 and K29 in NS5 dimerization.The basic residue K28 also participates in GTP binding and competition experiments indicate that NS5 dimerization is disrupted at high GTP concentrations.This competition represents a first glimpse at a molecular level explaining how dimerization might regulate the capping process. Author summaryThe lack of vaccine or antiviral drugs to combat Zika virus (ZIKV) infection has encouraged scientists to characterize in depth potential drug targets.One attractive candidate is NS5, responsible for the catalysis of the 5'-RNA capping, methylation and RNA synthesis, during flavivirus genome replication.To fulfill these activities, the methyltransferase and RNA-dependent RNA polymerase domains of NS5 need to cooperate with each other.The structural and biophysical data presented in this work demonstrate that the ZIKV NS5 protein has the ability to form dimers, as well as higher order oligomers that may participate in the fine-tuning regulation of the multiple enzyme functions in the replication complex.In addition, we have found that NS5 dimerization is disrupted at high GTP concentrations, explaining how dimerization might regulate the capping process.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,214
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations50
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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