Estimating the effect of the deleterious recessive haplotypes AH1 and AH2 on reproduction performance of Ayrshire cattle
Notice bibliographique
Résumé
The effects of 2 deleterious recessive haplotypes on reproduction performance of Ayrshire cattle, Ayrshire Haplotype 1 (AH1) and Ayrshire Haplotype 2 (AH2), were investigated in Canadian Ayrshire cattle. We calculated their phenotypic effects on stillbirth (SB) rate and 56-d nonreturn rate (NRR) by estimating the interaction of service sire carrier status with maternal grandsire carrier status using the official Canadian evaluation models for those 2 traits. The interaction term included 9 subclasses for the 3 possible statuses of each bull: haplotype carrier, noncarrier, or not genotyped. For AH1, 394 carriers and 1,433 noncarriers were available, whereas 313 carriers and 1,543 noncarriers were available for the AH2 haplotype. The number of matings considered for SB was 34,312 for heifers (first parity) and 115,935 for cows (later parities). For NRR, 49,479 matings for heifers and 160,528 for cows were used to estimate the haplotype effects. We observed a negative effect of AH1 on SB rates, which was 2.0% higher for matings of AH1-carrier sires to dams that had an AH1-carrier sire; this effect was found for both heifers and cows. However, AH1 had small, generally nonsignificant effects on NRR. The AH2 haplotype had a substantial negative effect on NRR, with 5.1% more heifers and 4.0% more cows returning to service, but the effects on SB rates were inconsistent and mostly small effects. Our results validate the harmful effects of AH1 and AH2 on reproduction traits in the Canadian Ayrshire population. This information will be of great interest for the dairy industry, allowing producers to make mating decisions that would reduce reproductive losses.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».