Differential miRNA Expression in Ileal and Colonic Tissues Reveals an Altered Immunoregulatory Molecular Profile in Individuals With Crohn’s Disease versus Healthy Subjects
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: MicroRNAs [miRNAs] are key modulators of gene expression in Crohn's disease [CD] and may drive tissue-specific molecular alterations underlying CD susceptibility. In this study, we analysed differential miRNA expression between CD and healthy subjects across ileal and colonic tissues. METHODS: A cohort of CD and healthy control [HC] subjects was recruited and clinical data collected. Endoscopically quiescent CD [CDq] was defined as inactive or mild by the Simple Endoscopic Score for CD. Total RNA was extracted from endoscopic biopsies taken from the terminal ileum and sigmoid colon. miRNA expression was quantified using NanoString Technologies. Statistical significance was assessed across biopsy site and diagnosis per miRNA, and corrected for multiple testing. RESULTS: In total, 23 CDq and 38 HC subjects were enrolled; 112 samples were included in the analysis, 51 from the ileum and 61 from the colon. We found 47 miRNAs differentially expressed by biopsy site in healthy tissue. Nine miRNAs were differentially expressed across HC and CDq, accounting for biopsy location. One of these, miR-223-3p, showed age and sex effects. We identified miRNA expression driven by diagnosis targeting genes involved in chemokine and cytokine signalling. miR-31-5p expression was driven by location and may be a biomarker for location subtypes in CD. CONCLUSIONS: We identified differentially expressed miRNAs in healthy ileal and colonic tissues. We discovered spatial miRNA expression patterns in CD and HC, suggesting site-specific regulation in subjects with no or minimal intestinal inflammation. These miRNAs target genes involved in immunoregulatory processes, suggesting a functional, tissue-specific role in CD.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».