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Enregistrement W2935942031 · doi:10.1002/dvg.23299

GNrep mouse: A reporter mouse for front–rear cell polarity

2019· article· en· W2935942031 sur OpenAlexaff
Pedro Barbacena, Marie Ouarné, Jody J. Haigh, Francisca F. Vasconcelos, Anna Pezzarossa, Cláudio A. Franco

Notice bibliographique

Revuegenesis · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular Mechanics and Interactions
Établissements canadiensUniversity of ManitobaResearch Institute in Oncology and HematologyCancerCare Manitoba
Organismes subventionnairesH2020 European Research CouncilHorizon 2020 Framework ProgrammeH2020 Spreading Excellence and Widening ParticipationMinistério da Ciência, Tecnologia e Ensino SuperiorFondation LeducqFundação para a Ciência e a TecnologiaFlorida State University
Mots-clésmCherryPolarity (international relations)Cell polarityCell biologyLive cell imagingGolgi apparatusGreen fluorescent proteinBiologyTransfectionCell cultureCellGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cell migration is essential during development, regeneration, homeostasis, and disease. Depending on the microenvironment, cells use different mechanisms to migrate. Yet, all modes of migration require the establishment of an intracellular front-rear polarity axis for directional movement. Although front-rear polarity can be easily identified in in vitro conditions, its assessment in vivo by live-imaging is challenging due to tissue complexity and lack of reliable markers. Here, we describe a novel and unique double fluorescent reporter mouse line to study front-rear cell polarity in living tissues, called GNrep. This mouse line simultaneously labels Golgi complexes and nuclei allowing the assignment of a nucleus-to-Golgi axis to each cell, which functions as a readout for cell front-rear polarity. As a proof-of-principle, we validated the efficiency of the GNrep line using an endothelial-specific Cre mouse line. We show that the GNrep labels the nucleus and the Golgi apparatus of endothelial cells with very high efficiency and high specificity. Importantly, the features of fluorescent intensity and localization for both mCherry and eGFP fluorescent intensity and localization allow automated segmentation and assignment of polarity vectors in complex tissues, making GNrep a great tool to study cell behavior in large-scale automated analyses. Altogether, the GNrep mouse line, in combination with different Cre recombinase lines, is a novel and unique tool to study of front-rear polarity in mice, both in fixed tissues or in intravital live imaging. This new line will be instrumental to understand cell migration and polarity in development, homeostasis, and disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,013
Score d'incertitude au seuil0,042

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0030,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0020,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0130,006

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,228
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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