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Enregistrement W2936477178 · doi:10.1172/jci79990

ATP6AP2 variant impairs CNS development and neuronal survival to cause fulminant neurodegeneration

2019· article· en· W2936477178 sur OpenAlexaff
Takuo Hirose, Alfredo Cabrera‐Socorro, David Chitayat, Thomas Lemonnier, Olivier Féraud, Carmen Cifuentes-Díaz, Nicolas Gervasi, Cédric Mombereau, Tanay Ghosh, Loredana Elena Stoica, Jeanne d’Arc Al Bacha, Hiroshi Yamada, Marcel A. Lauterbach, Marc Guillon, Kiriko Kaneko, Joy Norris, Komudi Siriwardena, Susan Blasér, Jérémie Teillon, Roberto Mendoza‐Londono, Marion Russeau, Julien Hadoux, Sadayoshi Ito, Pierre Corvol, Maria Gisele Matheus, Kenton R. Holden, Kohji Takei, Valentina Emiliani, Annelise Bennaceur‐Griscelli, Charles E. Schwartz, Geneviève Nguyen, Matthias Groszer

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Investigation · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMitochondrial Function and Pathology
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenUniversity of TorontoSickKids FoundationMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesNIH Clinical CenterJapan Science and Technology AgencyNational Institutes of HealthNational Institute of Neurological Disorders and StrokeTohoku Medical and Pharmaceutical UniversityUniversität des SaarlandesCentre National de la Recherche ScientifiqueAgence Nationale de la RechercheUniversität ZürichEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentEuropean CommissionFondation pour la Recherche MédicaleInstitut National de la Santé et de la Recherche Médicale
Mots-clésNeurodegenerationFulminantBiologyMedicineNeuroscienceBioinformaticsImmunologyPathologyDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Vacuolar H+-ATPase-dependent (V-ATPase-dependent) functions are critical for neural proteostasis and are involved in neurodegeneration and brain tumorigenesis. We identified a patient with fulminant neurodegeneration of the developing brain carrying a de novo splice site variant in ATP6AP2 encoding an accessory protein of the V-ATPase. Functional studies of induced pluripotent stem cell-derived (iPSC-derived) neurons from this patient revealed reduced spontaneous activity and severe deficiency in lysosomal acidification and protein degradation leading to neuronal cell death. These deficiencies could be rescued by expression of full-length ATP6AP2. Conditional deletion of Atp6ap2 in developing mouse brain impaired V-ATPase-dependent functions, causing impaired neural stem cell self-renewal, premature neuronal differentiation, and apoptosis resulting in degeneration of nearly the entire cortex. In vitro studies revealed that ATP6AP2 deficiency decreases V-ATPase membrane assembly and increases endosomal-lysosomal fusion. We conclude that ATP6AP2 is a key mediator of V-ATPase-dependent signaling and protein degradation in the developing human central nervous system.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,692
Score d'incertitude au seuil0,340

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,059
Tête enseignante GPT0,330
Écart entre enseignants0,272 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations58
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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