Systems Biology Approaches and Precision Oral Health: A Circadian Clock Perspective
Notice bibliographique
Résumé
A vast majority of the pathophysiological and metabolic processes in humans are temporally controlled by a master circadian clock located centrally in the hypothalamic suprachiasmatic nucleus of the brain, as well as by specialized peripheral oscillators located in other body tissues. This circadian clock system generates a rhythmical diurnal transcriptional-translational cycle in clock genes and protein expression and activities regulating numerous downstream target genes. Clock genes as key regulators of physiological function and dysfunction of the circadian clock have been linked to various diseases and multiple morbidities. Emerging omics technologies permits largescale multi-dimensional investigations of the molecular landscape of a given disease and the comprehensive characterization of its underlying cellular components (e.g., proteins, genes, lipids, metabolites), their mechanism of actions, functional networks and regulatory systems. Ultimately, they can be used to better understand disease and interpatient heterogeneity, individual profile, identify personalized targetable key molecules and pathways, discover novel biomarkers and genetic alterations, which collectively can allow for a better patient stratification into clinically relevant subgroups to improve disease prediction and prevention, early diagnostic, clinical outcomes, therapeutic benefits, patient's quality of life and survival. The use of "omics" technologies has allowed for recent breakthroughs in several scientific domains, including in the field of circadian clock biology. Although studies have explored the role of clock genes using circadiOmics (which integrates circadian omics, such as genomics, transcriptomics, proteomics and metabolomics) in human disease, no such studies have investigated the implications of circadian disruption in oral, head and neck pathologies using multi-omics approaches and linking the omics data to patient-specific circadian profiles. There is a burgeoning body of evidence that circadian clock controls the development and homeostasis of oral and maxillofacial structures, such as salivary glands, teeth and oral epithelium. Hence, in the current era of precision medicine and dentistry and patient-centered health care, it is becoming evident that a multi-omics approach is needed to improve our understanding of the role of circadian clock-controlled key players in the regulation of head and neck pathologies. This review discusses current knowledge on the role of the circadian clock and the contribution of omics-based approaches toward a novel precision health era for diagnosing and treating head and neck pathologies, with an emphasis on oral, head and neck cancer and Sjögren's syndrome.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,006 | 0,004 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,009 |
| Communication savante | 0,005 | 0,005 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,003 |
| Intégrité de la recherche | 0,003 | 0,005 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».