Molecular marker assisted introgression of loose and covered smut resistance into CDC McGwire hulless barley
Notice bibliographique
Résumé
CDC McGwire is a high yielding hulless barley cultivar from the Crop Development Centre (CDC), University of Saskatchewan which is susceptible to both true loose and covered smut. Screening for these diseases is time, labour and space consuming and escapes are very frequent making it necessary to screen putative resistant lines several times to confirm resistance. In addition, both the diseases are expressed in the inflorescence, simultaneous screening for them is not possible. Molecular Marker Assisted Selection (MAS) is a good alternative to combine the resistance to both diseases in the same line. Sequence characterized amplified region (SCAR) markers linked to the loose smut resistance gene Run8 (Eckstein et al. 2002) and covered smut resistance gene Ruhq (Ardiel et al. 2002, Grewal et al. 2004) have been developed at the CDC and a program was initiated to introgress loose smut resistance (Run8) and covered smut resistance (Ruhq) into CDC McGwire using MAS. Loose smut resistance was transferred from TR251 (Run8) and covered smut resistance from either Q21861 or TR640 (Ruhq). Two strategies (doubled haploidy and marker-assisted backcrossing) were used to introgress both resistance genes. Screening 35 microspore culture derived doubled haploid (DH) lines against covered and loose smut in the field and greenhouse showed that in most lines, the phenotype defined by disease reactions and genotype defined by the SCAR markers agreed. Screening putative resistant lines three times for covered and loose smut identified 12 DH lines resistant to both smuts and positive to molecular markers of both the diseases. In the marker-assisted backcross program, plants were genotyped in each generation and plants positive for both markers were backcrossed to CDC McGwire. The genotyping of BC1F1, BC2F1 and BC3F1 plants with SCAR markers (UhR450 and Un8700R) showed a 1:2:2:1 segregation indicating the presence of two major genes. Twenty BC3F3 lines (10 lines selected with the covered smut resistance from Q21861 and 10 lines selected with the covered smut resistance from TR640) were evaluated for covered smut reaction in the field in 2004 and in the greenhouse in the fall of 2004. All lines showed resistance to covered smut. BC3F3 lines were inoculated with loose smut in the field in 2004 and evaluated in the greenhouse. Eighteen of 20 lines showed loose smut resistance. These putative double resistant lines will be phenotyped in BC3F5 generations to confirm disease reactions. These results confirm that molecular markers can assist in rapid introgression of simply inherited disease resistance genes into elite lines with considerable savings in time and cost.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».