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Enregistrement W2937093529 · doi:10.1094/pdis-05-18-0855-re

An Improved Evans Blue Staining Method for Consistent, Accurate Assessment of <i>Plasmodiophora brassicae</i> Resting Spore Viability

2019· article· en· W2937093529 sur OpenAlexafffund
Michael W. Harding, T. Blake Hill, Yalong Yang, Greg C. Daniels, Sheau‐Fang Hwang, Stephen E. Strelkov, R. J. Howard, Jie Feng

Notice bibliographique

RevuePlant Disease · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Disease Resistance and Genetics
Établissements canadiensUniversity of AlbertaAgriculture Food and Rural Development
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food CanadaCanola Council of CanadaAlberta Agriculture and Forestry
Mots-clésSporeClubrootBiologyStainingPropidium monoazideStainEvans BlueVital stainMicrobiologyBrassicaBotanyReal-time polymerase chain reactionBiochemistryPhysiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Clubroot caused by Plasmodiophora brassicae is an important disease of brassica crops. The use of vital stains to determine the viability of P. brassicae resting spores can provide useful information regarding spore longevity, inoculum potential, or the efficacy of antimicrobial treatments. Evans blue is one example of a vital stain that has been reported to differentially stain viable and nonviable resting spores. Some previously published protocols using Evans blue to stain P. brassicae resting spores have not provided accurate or consistent results. In this study, we modified the Evans blue method by increasing the staining time to 8 h or more and evaluated P. brassicae resting spores after heat treatment at various combinations of temperature and time. Extending staining times significantly increased the numbers of stained resting spores up to 7 h, after which the numbers of stained spores did not change significantly (R 2 = 96.88; P ≤ 0.001). The accuracy of the modified method to discriminate viable and nonviable spores was evaluated in repeated experiments and by comparing the staining data with those derived from inoculation assays and propidium monoazide quantitative PCR (qPCR). The results demonstrated that the modified Evans blue staining method improved the accuracy and consistency of measurement of P. brassicae resting spore viability. Additionally, it was equivalent to the qPCR method for differentiating viable and nonviable spores (R 2 = 99.84; P ≤ 0.001) and confirmed in canola infection bioassays.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,753
Score d'incertitude au seuil0,374

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,301
Écart entre enseignants0,279 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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