An Improved Evans Blue Staining Method for Consistent, Accurate Assessment of <i>Plasmodiophora brassicae</i> Resting Spore Viability
Notice bibliographique
Résumé
Clubroot caused by Plasmodiophora brassicae is an important disease of brassica crops. The use of vital stains to determine the viability of P. brassicae resting spores can provide useful information regarding spore longevity, inoculum potential, or the efficacy of antimicrobial treatments. Evans blue is one example of a vital stain that has been reported to differentially stain viable and nonviable resting spores. Some previously published protocols using Evans blue to stain P. brassicae resting spores have not provided accurate or consistent results. In this study, we modified the Evans blue method by increasing the staining time to 8 h or more and evaluated P. brassicae resting spores after heat treatment at various combinations of temperature and time. Extending staining times significantly increased the numbers of stained resting spores up to 7 h, after which the numbers of stained spores did not change significantly (R2 = 96.88; P ≤ 0.001). The accuracy of the modified method to discriminate viable and nonviable spores was evaluated in repeated experiments and by comparing the staining data with those derived from inoculation assays and propidium monoazide quantitative PCR (qPCR). The results demonstrated that the modified Evans blue staining method improved the accuracy and consistency of measurement of P. brassicae resting spore viability. Additionally, it was equivalent to the qPCR method for differentiating viable and nonviable spores (R2 = 99.84; P ≤ 0.001) and confirmed in canola infection bioassays.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».