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Enregistrement W2937346600 · doi:10.1001/jamainternmed.2019.0600

Evaluating a New International Risk-Prediction Tool in IgA Nephropathy

2019· article· en· W2937346600 sur OpenAlexafffund
Sean J. Barbour, Rosanna Coppo, Hong Zhang, Yusuke Suzuki, Keiichi Matsuzaki, Ritsuko Katafuchi, Lee Er, Gabriela Espino-Hernández, S. Joseph Kim, Heather N. Reich, John Feehally, Daniel Cattran

Notice bibliographique

RevueJAMA Internal Medicine · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRenal Diseases and Glomerulopathies
Établissements canadiensUniversity of TorontoUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesFondazione Ricerca MolinetteRadboud Universitair Medisch CentrumUniverzita Karlova v PrazeOxford University Hospitals NHS Foundation TrustUniwersytet WarszawskiUniversità degli Studi di TorinoWarszawski Uniwersytet MedycznyKarolinska InstitutetOspedale Pediatrico Bambino GesùRadboud UniversiteitUniversity of OxfordCanadian Institutes of Health ResearchImperial College London
Mots-clésMedicineInterquartile rangeNephropathyRenal functionKidney diseaseInternal medicineProteinuriaCohortProportional hazards modelOncologyKidneyEndocrinologyDiabetes mellitus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Importance: Although IgA nephropathy (IgAN) is the most common glomerulonephritis in the world, there is no validated tool to predict disease progression. This limits patient-specific risk stratification and treatment decisions, clinical trial recruitment, and biomarker validation. Objective: To derive and externally validate a prediction model for disease progression in IgAN that can be applied at the time of kidney biopsy in multiple ethnic groups worldwide. Design, Setting, and Participants: We derived and externally validated a prediction model using clinical and histologic risk factors that are readily available in clinical practice. Large, multi-ethnic cohorts of adults with biopsy-proven IgAN were included from Europe, North America, China, and Japan. Main Outcomes and Measures: Cox proportional hazards models were used to analyze the risk of a 50% decline in estimated glomerular filtration rate (eGFR) or end-stage kidney disease, and were evaluated using the R2D measure, Akaike information criterion (AIC), C statistic, continuous net reclassification improvement (NRI), integrated discrimination improvement (IDI), and calibration plots. Results: The study included 3927 patients; mean age, 35.4 (interquartile range, 28.0-45.4) years; and 2173 (55.3%) were men. The following prediction models were created in a derivation cohort of 2781 patients: a clinical model that included eGFR, blood pressure, and proteinuria at biopsy; and 2 full models that also contained the MEST histologic score, age, medication use, and either racial/ethnic characteristics (white, Japanese, or Chinese) or no racial/ethnic characteristics, to allow application in other ethnic groups. Compared with the clinical model, the full models with and without race/ethnicity had better R2D (26.3% and 25.3%, respectively, vs 20.3%) and AIC (6338 and 6379, respectively, vs 6485), significant increases in C statistic from 0.78 to 0.82 and 0.81, respectively (ΔC, 0.04; 95% CI, 0.03-0.04 and ΔC, 0.03; 95% CI, 0.02-0.03, respectively), and significant improvement in reclassification as assessed by the NRI (0.18; 95% CI, 0.07-0.29 and 0.51; 95% CI, 0.39-0.62, respectively) and IDI (0.07; 95% CI, 0.06-0.08 and 0.06; 95% CI, 0.05-0.06, respectively). External validation was performed in a cohort of 1146 patients. For both full models, the C statistics (0.82; 95% CI, 0.81-0.83 with race/ethnicity; 0.81; 95% CI, 0.80-0.82 without race/ethnicity) and R2D (both 35.3%) were similar or better than in the validation cohort, with excellent calibration. Conclusions and Relevance: In this study, the 2 full prediction models were shown to be accurate and validated methods for predicting disease progression and patient risk stratification in IgAN in multi-ethnic cohorts, with additional applications to clinical trial design and biomarker research.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,025
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,073
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,025
Score d'incertitude au seuil0,131

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0250,073
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0040,002
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0030,002
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,334
Écart entre enseignants0,311 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations475
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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