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Enregistrement W2937369489

Benzopyrene disrupts cell growth dynamics and DNA methylation in breast cancer cells

2006· article· en· W2937369489 sur OpenAlexaffabout
Bekim Sadiković, David I. Rodenhiser

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDNA methylationCarcinogenesisCell growthCell cycleCarcinogenMethylationCancer researchBiologyBenzopyreneBenzo(a)pyreneCellCancerGene expressionMolecular biologyChemistryCell biologyDNAGeneGenetics
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

1630 Exposure to environmental carcinogens and unhealthy lifestyle choices can contribute to incidence of breast cancer. Benzo(a)pyrene (BaP) is one such environmental carcinogen present in automobile exhaust, industrial effluent and cigarette smoke. The primary carcinogenic effects of BaP are attributed to covalent DNA modifications and the deregulation of gene expression. Furthermore, disruptions in DNA methylation represent an additional, but poorly-understood mechanism of BaP-induced carcinogenesis. Changes in normal DNA methylation patterns that ensure proper gene expression and chromosomal stability can result in deregulated gene expression and a loss of genomic integrity. However, the specific roles of environmental contaminants as contributors to breast tumourigenesis are poorly understood. We tested the effects of BaP exposure on cellular growth dynamics and DNA methylation in various breast cancer cell lines. Cells were exposed to BaP in a time and concentration dependent manner and we evaluated the effects of BaP-exposure on cell proliferation and cell cycle, as well as gene-specific and global changes in DNA methylation. Our data show drastic differences in BaP-induced proliferative and cell cycle responses across these breast cancer cell lines. Specifically, we observed time and BaP concentration dependent loss of proliferation, S phase and G2M accumulation, and apoptosis in p53 positive MCF-7 and T47-D, (but not p53 negative HCC1806 and MDA MB231 cells). Furthermore, we observed increases in both p53 and p21 protein levels in BaP treated cells, while pretreatment with the p53-specific inhibitor pifithrin led to decreases in p53 and p21 levels and increase in proliferation. We also assessed DNA methylation dynamics using the methylation fingerprinting technique called amplification of intermethylated sites (AIMS), and we performed sequence analysis of differentially methylated DNA. Each cell line showed changes in global DNA methylation levels using the methyl acceptor assay (MAA), as well as gene-specific hypo- and hypermethylation events. Furthermore, we identified specific BaP-induced hypomethylation events in genomic repeats. Our data confirm altered DNA methylation patterns as a consequence of benzopyrene treatment and reinforce the link between environmental exposures, DNA methylation and breast cancer. (Funded by the Canadian Breast Cancer Research Alliance).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,335
Écart entre enseignants0,318 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2006
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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