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Enregistrement W2937441727 · doi:10.1371/journal.pgen.1007739

Associations of variants In the hexokinase 1 and interleukin 18 receptor regions with oxyhemoglobin saturation during sleep

2019· review· en· W2937441727 sur OpenAlex
Brian E. Cade, Han Chen, Adrienne M. Stilp, Tin Louie, Sonia Ancoli‐Israel, Raanan Arens, Richard Barfield, Jennifer E. Below, Jianwen Cai, Matthew P. Conomos, Daniel S. Evans, Alexis C. Wood, Sina A. Gharib, Kevin J. Gleason, Daniel J. Gottlieb, David R. Hillman, W. Craig Johnson, David J. Lederer, Jiwon Lee, José S. Loredo, Hao Mei, Sutapa Mukherjee, Sanjay R. Patel, Wendy S. Post, Shaun Purcell, Alberto R. Ramos, Kathryn J. Reid, Kenneth Rice, Neomi Shah, Tamar Sofer, Kent D. Taylor, Timothy A. Thornton, Heming Wang, Kristine Yaffe, Phyllis C. Zee, Craig L. Hanis, Lyle J. Palmer, Jerome I. Rotter, Katie L. Stone, Gregory J. Tranah, James G. Wilson, Shamil Sunyaev, Cathy C. Laurie, Xiaofeng Zhu, Richa Saxena, Xihong Lin, Susan Redline

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevuePLoS Genetics · 2019
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueErythrocyte Function and Pathophysiology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentNational Institute on Minority Health and Health DisparitiesNational Center for Advancing Translational SciencesNational Institute of Dental and Craniofacial ResearchNational Institute of Environmental Health SciencesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institute of General Medical SciencesNational Institute on AgingUniversity of Illinois at Urbana-ChampaignAmerican Thoracic SocietyBroad InstituteNational Center for Research ResourcesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesUniversity of Texas Health Science Center at HoustonNational Human Genome Research InstituteBrigham and Women's HospitalOntario Institute for Cancer ResearchUniversity of TorontoHollywood Private Hospital Research FoundationNational Institute of Arthritis and Musculoskeletal and Skin DiseasesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesJackson State UniversityJohns Hopkins UniversityNational Heart, Lung, and Blood InstituteUniversity of MiamiNorthwestern UniversityUniversity of MinnesotaSan Diego State UniversityNational Institutes of HealthOffice of Dietary SupplementsU.S. Department of Health and Human Services
Mots-clésBiologyHexokinaseGeneticsEndocrinologyGlycolysisMetabolism

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Sleep disordered breathing (SDB)-related overnight hypoxemia is associated with cardiometabolic disease and other comorbidities. Understanding the genetic bases for variations in nocturnal hypoxemia may help understand mechanisms influencing oxygenation and SDB-related mortality. We conducted genome-wide association tests across 10 cohorts and 4 populations to identify genetic variants associated with three correlated measures of overnight oxyhemoglobin saturation: average and minimum oxyhemoglobin saturation during sleep and the percent of sleep with oxyhemoglobin saturation under 90%. The discovery sample consisted of 8,326 individuals. Variants with p < 1 × 10(-6) were analyzed in a replication group of 14,410 individuals. We identified 3 significantly associated regions, including 2 regions in multi-ethnic analyses (2q12, 10q22). SNPs in the 2q12 region associated with minimum SpO2 (rs78136548 p = 2.70 × 10(-10)). SNPs at 10q22 were associated with all three traits including average SpO2 (rs72805692 p = 4.58 × 10(-8)). SNPs in both regions were associated in over 20,000 individuals and are supported by prior associations or functional evidence. Four additional significant regions were detected in secondary sex-stratified and combined discovery and replication analyses, including a region overlapping Reelin, a known marker of respiratory complex neurons.These are the first genome-wide significant findings reported for oxyhemoglobin saturation during sleep, a phenotype of high clinical interest. Our replicated associations with HK1 and IL18R1 suggest that variants in inflammatory pathways, such as the biologically-plausible NLRP3 inflammasome, may contribute to nocturnal hypoxemia.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,867
Score d'incertitude au seuil0,513

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,086
Tête enseignante GPT0,313
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle