The histone chaperone CAF-1 cooperates with the DNA methyltransferases to maintain <i>Cd4</i> silencing in cytotoxic T cells
Notice bibliographique
Résumé
The transcriptional repression of alternative lineage genes is critical for cell fate commitment. Mechanisms by which locus-specific gene silencing is initiated and heritably maintained during cell division are not clearly understood. To study the maintenance of silent gene states, we investigated how the Cd4 gene is stably repressed in CD8 + T cells. Through CRISPR and shRNA screening, we identified the histone chaperone CAF-1 as a critical component for Cd4 repression. We found that the large subunit of CAF-1, Chaf1a, requires the N-terminal KER domain to associate with the histone deacetylases HDAC1/2 and the histone demethylase LSD1, enzymes that also participate in Cd4 silencing. When CAF-1 was lacking, Cd4 derepression was markedly enhanced in the absence of the de novo DNA methyltransferase Dnmt3a but not the maintenance DNA methyltransferase Dnmt1. In contrast to Dnmt1, Dnmt3a deficiency did not significantly alter levels of DNA methylation at the Cd4 locus. Instead, Dnmt3a deficiency sensitized CD8 + T cells to Cd4 derepression mediated by compromised functions of histone-modifying factors, including the enzymes associated with CAF-1. Thus, we propose that the heritable silencing of the Cd4 gene in CD8 + T cells exploits cooperative functions among the DNA methyltransferases, CAF-1, and histone-modifying enzymes.
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».