Intragenomic nuclear RNA variation in a cryptic <i>Amanita</i> taxon
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Amanita cf. lavendula collections in eastern North America, Mexico, and Costa Rica were found to consist of four cryptic taxa, one of which exhibited consistently unreadable nuclear rDNA ITS1-5.8S-ITS2 (fungal barcode) sequences after ITS1 base 130. This taxon is designated here as Amanita cf. lavendula taxon 1. ITS sequences from dikaryotic basidiomata were cloned, but sequences recovered from cloning did not segregate into distinct haplotypes. Rather, there was a mix of haplotypes that varied among themselves predominantly at 28 ITS positions. Analysis of each of these 28 variable bases showed predominantly two alternate bases at each position. Based on these findings and additional sequence data from the nuclear rDNA 28S, RNA polymerase II subunit 2 (RPB2) and mitochondrial rDNA small subunit (SSU) and 23S genes, we speculate that taxon 1 represents an initial hybridization event between two divergent taxa followed by failure of the ribosomal repeat to homogenize. Homogenization failure may be a result of repeated hybridization between divergent internal transcribed spacer (ITS) types with inadequate time for concerted evolution of the ribosomal repeat or, alternately, a complete failure of the ribosomal homogenization process. To our knowledge, this finding represents the first report of a geographically widespread taxon (Canada, eastern USA, Costa Rica) with apparent homogenization failure across all collections. Findings such as these have implications for fungal barcoding efforts and the application of fungal barcodes in identifying environmental sequences.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,015 | 0,005 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle