MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2939009664 · doi:10.1136/jmedgenet-2019-106005

Mutation-specific Fabry disease patient-derived cell model to evaluate the amenability to chaperone therapy

2019· article· en· W2939009664 sur OpenAlex
Malte Lenders, Franciska Stappers, Christoph Niemietz, Boris Schmitz, Michel Boutin, Paula Ballmaier, Andree Zibert, Hartmut Schmidt, Stefan‐Martin Brand, Christiane Auray‐Blais, Eva Brand

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueJournal of Medical Genetics · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLysosomal Storage Disorders Research
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesAmicus TherapeuticsBioMarin PharmaceuticalSanofi
Mots-clésHEK 293 cellsChaperone (clinical)TransfectionMissense mutationMutantChimera (genetics)IntracellularCell biologyChemistryCell cultureMolecular biologyMedicineMutationCancer researchBiologyGeneticsBiochemistryGenePathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Patients with Fabry disease (FD) and amenable mutations can be treated with the chaperone migalastat to restore endogenous α-galactosidase A (AGAL) activity. However, certain amenable mutations do not respond biochemically in vivo as expected. Here, we aimed to establish a patient-specific and mutation-specific cell model to evaluate the amenability to chaperone therapy in FD. METHODS: Since current tests to determine amenability are limited to heterologous mutation expression in HEK293T cells with endogenous AGAL activity, we generated CRISPR/Cas9-mediated AGAL-deficient HEK293T cells as a basis for mutant overexpression. Furthermore, primary urinary cells from patients were isolated and immortalised as a patient-specific cell model system to evaluate the amenability to chaperone therapy. RESULTS: Under treatment (>13 months), carriers of p.N215S (n=6) showed a significant reduction of plasma lyso-Gb3 (p<0.05). Lyso-Gb3 levels in carriers of p.L294S increased (p<0.05) and two patients developed severe albuminuria. Both missense mutations were amenable in wild-type HEK293T cells (p<0.05), but presented different responses in CRISPR/Cas9-mediated AGAL knockouts and immortalised urinary cells. Chaperone incubation resulted in increased AGAL activity (p<0.0001) and intracellular globotriaosylceramide (Gb3) reduction (p<0.05) in immortalised p.N215S cells but not in p.L294S and IVS2+1 G>A cells. CONCLUSION: We conclude that repeated AGAL activity measurements in patients' white blood cells are mandatory to assess the in vivo amenability to migalastat. Plasma lyso-Gb3 might be an appropriate tool to measure the biochemical response to migalastat. Patients with low AGAL activities and increasing lyso-Gb3 levels despite in vitro amenability might not benefit sufficiently from chaperone treatment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,725
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,045
Tête enseignante GPT0,340
Écart entre enseignants0,295 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle