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Enregistrement W2939331446 · doi:10.1002/ijc.32315

HPV73 a nonvaccine type causes cervical cancer

2019· article· en· W2939331446 sur OpenAlexfundno aff
Sérgio Menezes Amaro Filho, Ana Gradíssimo, Mykhaylo Usyk, Fábio Cañellas Moreira, Liz Maria de Almeida, Miguel Ângelo Martins Moreira, Robert D. Burk

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Cancer · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCervical Cancer and HPV Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Cancer InstituteFundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio de JaneiroConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoPan American Health OrganizationCNIB
Mots-clésCervixCancerCervical cancerGeneBiologyComplementary DNAGenomeCancer researchMolecular diagnosticsVirusVirologyRNAOncologyMedicineGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

HPV73 is classified as possibly oncogenic. It is neither routinely evaluated in HPV screening, nor covered by any of the prophylactic vaccines. We sought to investigate the carcinogenic characteristics of HPV73. Molecular studies were performed on eight cervix cancer biopsy specimens containing HPV73 from a cross-sectional cancer cohort of 590 women referred to the National Cancer Institute in Rio de Janeiro, Brazil. Transcriptional activity of HPV73 was evaluated by detection of spliced transcripts of E6/E6* and E1^E4 in cDNA created from RNA isolated from fresh tissue. Disruption of viral E1 and E2 genes in the tumor DNA was assessed by overlapping PCR amplification. Evaluation of viral integration was performed using a customized capture panel and next-generation sequencing, and an in-house bioinformatic pipeline. HPV73 E6/E6* transcripts were found in 7/7 specimens with available RNA, and three also had HPV73 E1^E4 transcripts. Disruption of E1 and E2 genes was observed in 4/8 specimens. Integration of HPV73 sequences into the cancer cell genomes was identified in all cervix cancer tissues. These results provide evidence that HPV73 is an oncogenic virus that can cause invasive cervix cancer. With current molecular screening and HPV vaccination, not all cervix cancers will be prevented.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,427
Écart entre enseignants0,394 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations26
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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